ChIP-seq | ATAC-seq | RNA-seq | 數據分析流程
補充RNA-seq流程 以前都是自己搭RNA-seq流程，雖然可以完成任務，但是數據量一多，批次多起來，就非常難管理。 既然別人提供了這么好的流程，那就要用起來，管理起來不是一般的輕松。 ENCODE-DCC/rna-seq-pipeline 安裝比較麻煩，沒有針對local的一鍵安裝 ...
原文：A survey of best practices for RNA-seq data analysis RNA-seq數據分析指南
A survey of best practices for RNA seq data analysis RNA seq數據分析指南 內容 前言 各位同學 老師，大家好，現在由我給大家講講我的文獻閱讀報告 A survey of best practices for RNA seq data analysis,我把它叫做RNA seq數據分析指南。這篇文章是由佛羅里達大學等單位的研究人員在 月 日 ...
2018-06-28 21:24 0 941 推薦指數：
相關推薦
Current best practices in single-cell RNA-seq analysis: a tutorial
Current best practices in single-cell RNA-seq analysis: a tutorial 摘要 這篇文章主要闡述了一個典型的單細胞 RNA-seq 分析的詳細流程，包括了以下流程： pre-processing -數據預處理 ...
RNA-seq 數據的簡單分析
主要介紹如何分析RNA-seq 數據 參考文檔 Wikipedia-RNA-seq paper: RNA-Seq: a revolutionary tool for transcriptomics TopHat Cufflinks CummeRbund TopHat ...
使用limma、Glimma和edgeR，RNA-seq數據分析易如反掌
使用limma、Glimma和edgeR，RNA-seq數據分析易如反掌 Charity Law1, Monther Alhamdoosh2, Shian Su3, Xueyi Dong3, Luyi Tian1, Gordon K. Smyth4 and Matthew E. ...
使用limma、Glimma和edgeR，RNA-seq數據分析易如反掌
Contents 1 摘要 2 背景介紹 3 初始配置 4 數據整合 4.1 讀入計數數據 4.2 組織樣品信息 4.3 組織基因注釋 5 數據預處理 5.1 原始數據尺度轉換 ...
什么是RNA-Seq (RNA Sequencing)
什么是RNA-Seq (RNA Sequencing) 2011-07-14 ~ ADMIN 隨着ome為詞尾的各種組學的出現，轉錄組學已經成為了人們了解生物信息的一個重要組成部分。人們使用了許多辦法來掌握轉錄組的情況，主要分為兩類，一類是基於雜交，一類是基於下一代測序技術 ...
RNA-seq(9):功能富集分析
這部分開始進行基本的富集分析，兩類 A：差異基因富集分析（不需要表達值，只需要gene name） B: 基因集(gene set)富集分析（不管有無差異，需要全部genes表達值 ...
無生物學重復RNA-seq分析 CORNAS: coverage-dependent RNA-Seq analysis of gene expression data without biological replicates
無生物學重復RNA-seq分析 CORNAS: coverage-dependent RNA-Seq analysis of gene expression data without biological replicates BMC Bioinformatics 的一篇文章中提出了一種新 ...