這里利用Nathan Yau所著的《鮮活的數據:數據可視化指南》一書中的數據,學習畫圖。 數據地址:http://datasets.flowingdata.com/ppg2008.csv ...
一:導入R包及需要畫熱圖的數據 library pheatmap data lt read.table F: R練習 R測試數據 heatmapdata.txt ,head T,row.names ,sep t 二:畫圖 pheatmap data 默認參數 pheatmap data,clustering distance rows correlation 聚類線長度優化 pheatmap da ...
2018-06-07 20:27 1 4060 推薦指數:
這里利用Nathan Yau所著的《鮮活的數據:數據可視化指南》一書中的數據,學習畫圖。 數據地址:http://datasets.flowingdata.com/ppg2008.csv ...
生成測試數據 繪圖首先需要數據。通過生成一堆的向量,轉換為矩陣,得到想要的數據。 data <- c(1:6, 6:1, 6:1, 1:6, (6:1)/10, ( ...
需要畫一個這樣的熱圖: heatmap: 下面介紹具體過程: 1.原始數據為兩個矩陣:rmsd_array,tm_rmsd_array result: 3.保留熱圖的上三角或下三角:(triu和tril對應上下三角 ...
先來看兩張圖: (1)10年世界杯決賽,冠軍西班牙隊中門將、后衛、中場及前鋒的跑位熱圖 通過熱圖,我們可以很清楚的看出四個球員在比賽中跑動位置的差異。 (2)歷史地震震源位置的熱圖 也可以很清楚的看出,哪個地方是地震的高發地區(頻率最高)。 HeatMap簡介 上面兩張就是熱圖 ...
HeatMap(熱圖)的原理和實現 先來看兩張圖: (1)10年世界杯決賽,冠軍西班牙隊中門將、后衛、中場及前鋒的跑位熱圖 通過熱圖,我們可以很清楚的看出四個球員在比賽中跑動位置的差異。 (2)歷史地震震源位置的熱圖 也可以很清楚的看出,哪個地方是地震的高發地區(頻率最高 ...
快速實現是搜索幫助文檔的首要目的,所以此處涉及實戰的文章一概略去傳統幫助文檔的理論部分,直接上代碼加注釋! 本文將介紹R語言下利用ggplot2包制作heatmap的代碼 -------------------------我是分割線 ...
如何利用R包qqman畫曼哈頓圖? 2017-07-10 lili 生信人 眾多周知,R語言提供了各種各樣的包,方便實現我們的目的,下面給大家介紹一個可以便捷的畫曼哈頓圖的包:qqman install.packages(“qqman”) # 安裝包 ...
Heatmap熱圖,可以非常直觀的呈現一些原本不易理解或表達的數據,比如密度、頻率、溫度等,改用區域和顏色這種更容易被人理解的方式來呈現。熱圖實際上是三維可視化的俯瞰效果。(顏色代表一個維度)。 我們對熱圖並不陌生,教科書里、天氣預報里的氣溫地圖是最典型的案例。 在用戶體驗制勝的微創新 ...