用--recode命令，--out表示轉化的文件的名字，本例已經命名為“filter” ...

1、PED簡介 PED文件格式是廣泛使用的用於連鎖系譜數據分析的格式，並用作plink程序的輸入。PLINK是一個免費的，開源的全基因組關聯分析工集，旨在以高計算效率的方式執行一系列基本的，大規模的分析。PED能夠處理二倍體SNP數據。 空格(空格或制表符)分隔的文本文件*.ped ...

BED 文件格式 BED 文件格式是一個可變方式的數據線，用來描述注釋的數據。BED線有3個要求的字段和9個額外的字段。每條線的字段數目必須是任意單條數據的在注釋上一致。可選字段的序試結合低數字的字段必須流行如果高位字段被使用。 首先是三個要求的BED字段 chrom ...

bed文件（browse extensive data）以及gff文件（general fearture format） bed文件 第一列是染色體或者contig信息。 第二列是起始位置，從0開始。 第三列是終止位置。 第四列是bed列的名字。 第五列是score。 第六列是鏈方向 ...

1）BED文件 BED 文件(Browser Extensible Data)格式是ucsc 的genome browser的一個格式 ,提供了一種靈活的方式來定義的數據行，以用來描述注釋信息。BED行有3個必須的列和9個額外可選的列。每行的數據格式要求一致(見下圖)。 每條線的字段 ...

（1） <?php function objtoarr($obj){$ret = array();foreach($obj as $key =>$value){if(gettype($v ...

一：腳本功能： 批量處理目錄以及子目錄下的文件格式問題，能夠輕易的將linux格式轉換為dos格式。 二：寫此博客的意義： 1、只是為了熟悉shell腳本,僅此而已 三：下面介紹兩種方法使用腳本： 1、本教程附帶給你腳本，按照教程使用即可，不用過多的了解內部代碼結構。 2、解釋 ...

1.利用Linux命令：awk 2.用法如下： awk '{if(NR%4 == 1){print ">" substr($0, 2)}}{if(NR%4 == 2){print}}' fastq > fasta 3.上述用法注意事項： fastq文件必須是解壓格式 ...