使用bcftools提取指定樣本的vcf文件（extract specified samples in vcf format）
1、下載安裝bcftools。 2、准備樣本ID文件，這里命名為samplelistname.txt，一個樣本一行，如下所示： sample1 sample2 sample3 3、輸入命令： bcftools view -S samplelistname.txt ...
原文：plink提取指定樣本和指定SNP的數據（keep，extract函數）
一 提取樣本： 提取樣本見命令行： plink bfile file noweb keep sampleID.txt recode make bed out sample 其中，sampleID.txt第一列為提取的樣本Family ID，第二列為Within family ID IID 同樣的，如果是去除樣本，則用參數 remove 二 提取SNP位點 plink bfile file extr ...
2018-05-04 16:47 0 2336 推薦指數：
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