【轉錄組入門】4：參考基因組和注釋文件
作業要求： 在UCSC下載hg19參考基因組，我博客有詳細說明，從gencode數據庫下載基因注釋文件，並且用IGV去查看你感興趣的基因的結構，比如TP53,KRAS,EGFR等等。 作業，截圖幾個基因的IGV可視化結構！還可以下載ENSEMBL，NCBI的gtf，也導入IGV看看，截圖基因結構 ...
原文：GRCh38基因組和注釋文件探究
ensembl release : cat Homo sapiens.GRCh . .gtf grep v cut f cut f , , , d grep gene biotype sed e s g sed e s g cut f , , d sort uniq gt GRCh .feature.info ENSG TSPAN protein coding ENSG TNMD protein ...
2018-03-28 16:05 0 3414 推薦指數：
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