1. 准備文件: ref.fa ref.gtf或者gff3,最好是gtf3,可將gff3轉化為gtf sample.vcf 2. 用gff3ToGenePred與gtfToGen ...
ANNOVAR 注釋軟件 ANNOVAR簡介 ANNOVAR結構 ANNOVAR下載數據庫 ANNOVAR輸入格式 ANNOVAR格式轉換 ANNOVAR注釋功能 用table annovar.pl進行注釋 可一次性完成三種類型的注釋 Gene based Annotation 基於基因的注釋 ex .variant function ex .exonic variant function Re ...
2017-12-29 16:13 0 2638 推薦指數:
1. 准備文件: ref.fa ref.gtf或者gff3,最好是gtf3,可將gff3轉化為gtf sample.vcf 2. 用gff3ToGenePred與gtfToGen ...
1. 文件准備 COSMIC相關文件下載 COSMIC更新了下載規則。以前直接用ftp可以下載,現在麻煩一些,要根據它們提供的指導規則下載。 以GRCh37/cosmic/v90/VCF/Cosm ...
annovar一般只包含人類基因組注釋數據庫,其他的物種如小鼠需要自己進行建立注釋信息。 第一步:下載annovar軟件上Annovar官網下載(http://annovar.openbioinformatics.org/en/latest/user-guide/download/),現在要郵件 ...
,則程序還生成新的VCF輸出文件,其中INFO字段填充有注釋信息。 假設我們已經下載了ANNOVAR包 ...
MySQL查詢表注釋和字段注釋信息 記錄備查 ...
修改還未push的注釋: git commit --amend 修改后保存退出。 剛剛push到遠端還沒有人其他人下載或改動的: git commit --amend進入修改頁面修改注釋信息,修改后:wq保存退出。 再使用git push --force-with-lease origin ...
ALTER TABLE Flight_data.AirData COMMENT COLUMN Icao '注釋信息' ...
1、獲取表: user_tables: TABLE_NAME,TABLESPACE_NAME,LAST_ANALYZED等 dba_tables: ower,table_name,tables ...