原文:Annovar 信息注釋

ANNOVAR 注釋軟件 ANNOVAR簡介 ANNOVAR結構 ANNOVAR下載數據庫 ANNOVAR輸入格式 ANNOVAR格式轉換 ANNOVAR注釋功能 用table annovar.pl進行注釋 可一次性完成三種類型的注釋 Gene based Annotation 基於基因的注釋 ex .variant function ex .exonic variant function Re ...

2017-12-29 16:13 0 2638 推薦指數:

查看詳情

annovar 注釋除人類以外的SNP

1. 准備文件: ref.fa ref.gtf或者gff3,最好是gtf3,可將gff3轉化為gtf sample.vcf 2. 用gff3ToGenePred與gtfToGen ...

Tue Sep 03 20:06:00 CST 2019 0 358
制作annovar注釋依賴的cosmic數據庫

1. 文件准備 COSMIC相關文件下載 COSMIC更新了下載規則。以前直接用ftp可以下載,現在麻煩一些,要根據它們提供的指導規則下載。 以GRCh37/cosmic/v90/VCF/Cosm ...

Fri Sep 20 18:13:00 CST 2019 0 401
Annovar注釋非人類基因組,如小鼠mm9

annovar一般只包含人類基因組注釋數據庫,其他的物種如小鼠需要自己進行建立注釋信息。 第一步:下載annovar軟件上Annovar官網下載(http://annovar.openbioinformatics.org/en/latest/user-guide/download/),現在要郵件 ...

Tue Jul 04 05:19:00 CST 2017 0 1576
ANNOVAR工具

,則程序還生成新的VCF輸出文件,其中INFO字段填充有注釋信息。 假設我們已經下載了ANNOVAR包 ...

Thu Jul 19 05:07:00 CST 2018 0 1199
git修改push的注釋信息

修改還未push的注釋: git commit --amend 修改后保存退出。 剛剛push到遠端還沒有人其他人下載或改動的: git commit --amend進入修改頁面修改注釋信息,修改后:wq保存退出。 再使用git push --force-with-lease origin ...

Mon Mar 11 17:57:00 CST 2019 0 1400
 
粵ICP備18138465號   © 2018-2025 CODEPRJ.COM