目錄 1.准備本地數據庫文件 1.1 NR庫下載 1.2 Taxonomy數據庫下載 2.按物種拆分NR庫 2.1 第一步:獲得Aceesson和分類物種的對應關系 2.2 第二步:獲得分類物種的序列 ...
目前有很多的數據庫都存儲了蛋白序列,比如NCBI Refseq, protein, swissprot 等,在各個數據庫之間,或者是在某個數據庫中,蛋白序列有大量冗余 為了方便使用,ncbi 構建了nr 庫, 全稱是 RefSeq non redundant proteins Non redundant protein sequences from GenPept, Swissprot, PIR, ...
2017-12-22 16:27 4 13328 推薦指數:
目錄 1.准備本地數據庫文件 1.1 NR庫下載 1.2 Taxonomy數據庫下載 2.按物種拆分NR庫 2.1 第一步:獲得Aceesson和分類物種的對應關系 2.2 第二步:獲得分類物種的序列 ...
1.1 數據庫介紹 1.1.1什么是數據庫 簡單的說,數據庫(database)就是一個存放數據的倉庫,這個倉庫是按照一定的數據結構(數據結構是指數據的組織形式或數據之間的聯系)來組織、存儲的,我們可以通過數據提供的多種方法來管理數據庫里的數據。 當人們收集了大量的數據后,應該 ...
一、數據庫(databas,db) 數據庫指的是長期存在計算機內、有組織、可共享的、大量數據的集合。數據是按照特定的數據模型來組織、存儲在數據庫中的。 二、數據庫管理系統(DataBase Mangement System,DBMS) 數據庫管理系統是對數據庫進行管理的軟件集合,完成艱苦 ...
一 數據庫管理軟件的由來 基於我們之前所學,數據要想永久保存,都是保存於文件中,毫無疑問,一個文件僅僅只能存在於某一台機器上。 如果我們暫且忽略直接基於文件來存取數據的效率問題,並且假設程序所有的組件都運行在一台機器上,那么用文件存取數據,並沒有問題。 很不幸,這些假設都是你自己意淫 ...
—NR/NT,Taxonomy和RefSeq。 NR/NT 數據庫 NR(Non-Redun ...
mariadb(默認端口3306) 什么是數據庫? 白話:用來存放數據的倉庫,這個倉庫只不過是按照一定的數據結構來組織。 數據庫模型分為三種: 層次式數據庫 網絡式數據庫 關系型數據庫和非關系數據庫 什么是關系型數據庫: 由很多二維表(x橫y豎)組成,一行代表一條信息,一列代表類型 ...
Hbase概念: 常用的oracle、mySQL數據庫都是面向行儲存的,而hbase是面向列儲存的數據庫,儲存本身具有水平延展性。 hbase有兩個主要概念:Row key和Column Famliy Column Famliy又稱為“列族”,每一個Column Family都可以 ...
Ensembl是一項生物信息學研究計划,旨在開發一種能夠對真核生物基因組進行自動詮釋(automatic annotation)並加以維護的軟件。該計划由英國維康基金桑格研究院及歐洲分子生物學實 ...