1.>c-Bioportal: www.cbioportal.org 整合和簡化了包括TCGA,ICGC以及GEO等多個癌症基因組數據庫的內容,提供友好可視化的界面,可供下載。 主要展示基因的somatic 突變譜,拷貝數變化,mRNA&miRNA表達量變化,DNA甲基化 ...
中國大牛力作 張澤民: http: gepia.cancer pku.cn index.html http: cancer pku.cn ...
2017-12-22 11:26 0 1973 推薦指數:
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最出名,http://www.cbioportal.org/ 特色:最基本的簡單分析基因突變、共表達/共突變的基因,下載數據也可以,最常看的應該還是oncoPrint那個。 詳細用法:TCGA數據庫的數據怎么查? 最方便,Ge-mini 特色:手機app,可隨時查看,主要關注基因表達 ...
本文首發於公眾號“生信補給站”,https://mp.weixin.qq.com/s/WG4JHs9RSm5IEJiiGEzDkg 之前介紹了使用maftools | 從頭開始 ...
TCGA數據庫 是 生物信息分析經常需要用到的數據庫,今天學習了一下怎么在其官網上下載數據集 以下以下載腎上腺皮質癌患者的miRNA表達數據為例,來講解具體的過程 第一步,打開TCGA網址:https://portal.gdc.cancer.gov 第二步,點擊導航欄最右 ...
http://mirgator.kobic.re.kr/help.html ...
http://mexpress.be/ ...
https://github.com/Jialab-UCR/GDCRNATools GDCRNATools - An R package for downloading, organizing ...
上周收到一條求助信息:“如何用TCGA數據庫分析LINC00152在卵巢癌與正常組織的的表達差異?” 所以以這個題目為記錄分析過程如下: 一、下載數據 a)進入網站https://cancergenome.nih.gov/ 網頁截圖如下: b)進入數據下載 Launch ...