核苷酸和氨基酸蛋白序列轉換的工具
在線序列轉換的工具： Nucleotide Sequence Translation Protein Sequence Back-translation http://bio.lundberg.gu.se/edu/translat.html http://www.ebi.ac.uk ...
原文：從細菌GFF文件提取CDS序列並轉換為氨基酸序列
最近在上生物信息學原理，打算記錄一些課上的作業。第一次作業：如題。 基本思路： .從GFF中讀取CDS的起始終止位置以及正負鏈信息。GFF格式見 http: blog.sina.com.cn s blog a f e yd l.html. .利用起始 終止位置等信息從FNA文件中提取CDS序列。FNA格式見 http: boyun.sh.cn bio p . .利用CDS序列及密碼子表得到FAA文 ...
2017-11-26 22:34 1 2429 推薦指數：
相關推薦
鹼基序列轉換成氨基酸序列
...
shell實現鹼基/氨基酸序列提取（sed,grep,awk三大利器走向天下）
假定存在file.fa文件，其序列如下所示： 現在有四個任務，分別如下所示： 任務一：提取包含“RBFOX1”字符的序列 第一步：sed -i '/>/i\@' file.fa file.fa指的是包含所有序列的文件；這一步的意思是在以">"開頭的字符串前一行 ...
gff文件提取cds
...
【Python小試】將核酸序列翻譯成氨基酸序列
三聯密碼表 測試 結果 MFGDAT_R ...
【Python小試】計算蛋白序列中指定氨基酸所占的比例
編碼 解析 Python assert（斷言）用於判斷一個表達式，在表達式條件為 False 的時候觸發異常。 斷言可以在條件不滿足程序運行的情況下直接返回錯誤，而不必等待程序運行后出現崩潰的 ...
支鏈氨基酸
蛋白質中的三種常見氨基酸，即亮氨酸、 纈氨酸和異亮氨酸的統稱支鏈氨基酸(BCAA)，所以又可稱復合支鏈氨基酸。 這類氨基酸以兩種特殊方式促進合成代謝（肌肉增長）：①促進胰島素釋放，②促進生長激素釋放。支鏈氨基酸中最重要的是 亮氨酸，即酮異己酸（KIC）和HMB的前身。KIC ...
支鏈氨基酸怎么吃
支鏈氨基酸的食用方法 支鏈氨基酸有很多可以服用的時間，比如力量訓練開始的時候，馬上就要做有氧運動的時候，以及健身活動結束的時候，還有很多人選擇在睡覺之前。 不用精確到具體多少分鍾，因為支鏈氨基酸不是需要計算峰值作用的補劑，它可以被儲存在身體里。力量訓練開始前，換完衣服吃幾個支鏈 ...