【轉錄組入門】3：了解fastq測序數據
操作：需要用安裝好的sratoolkit把sra文件轉換為fastq格式的測序文件，並且用fastqc軟件測試測序文件的質量 作業：理解測序reads，GC含量，質量值，接頭，index，fastqc的全部報告，搜索中文教程 具體步驟 【1】SRA文件轉換成fastq文件 ...
原文：轉錄組入門(3)：了解fastq測序數據
sra文件轉換為fastq格式 fastq dump h split 也就是說如果SRA文件中只有一個文件，那么這個參數就會被忽略。如果原文件中有兩個文件，那么它就會把成對的文件按 .fastq， .fastq這樣分開。如果還出現了第三個文件，就意味着這個文件本身是未成配對的部分。可能是當初提交的時候因為事先過濾過了一下，所以有一部分數據被刪除了。 gzip 輸出文件壓縮成gzip格式 通常gz ...
2017-08-08 00:37 0 3962 推薦指數：
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