://github.com/chentianlu 另外,想要代謝入門的同學可讀讀她寫的代謝組學數據分析綜述 ...
年 月 日,核酸研究 Nucleic Acids Research 雜志上,在線公布了一個可搜索微生物次生代謝物合成基因組簇的綜合性數據庫antiSMASH數據庫 . 版,前 版年均引用 次,累計引物 可實現基因組與基因組之間的相關天然產物合成基因簇的查詢和預測。 臨床上使用的大部分抗生素和葯物均來自植物或微生物的天然產物。結合基因組挖掘的經典分離與分析法使得能鑒定和描述基於宏基因組的天然產物途 ...
2017-08-01 21:46 0 1296 推薦指數:
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植物基因組數據庫:1、NCBI中的genome,直接下載NCBI上的基因組文件 ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/ 2、植物基因組數據庫(包含約30個左右的植物,具體查看:) 30個左右植物基因組對應列表 下載 http ...
代謝物的鑒定流程 蛋白組比基因組和轉錄組落后一檔次,代謝組學比蛋白組又落后一檔次,僅化合物的鑒定就讓人頭疼。 流程如下: 化合物精確質量數 數據庫檢索 一級鑒定(篩選分子量相同的離子)。解決質量數問題。 一級鑒定(通過同位素分布比對,篩選分子量和元素組成相同的離子)。解決 ...
目錄 代謝物的鑒定流程 從譜圖到峰表 代謝物的鑒定流程 蛋白組比基因組和轉錄組落后一檔次,代謝組學比蛋白組又落后一檔次,僅化合物的鑒定就讓人頭疼。 流程如下: 化合物精確質量數 數據庫檢索 一級鑒定(篩選分子量相同的離子 ...
在數據分析中,經常需要下載物種的參考基因組序列,這時有很多數據庫可以選擇,比如NCBI, Ensembl, UCSC這三個通用的數據庫,或者該物種特有的數據庫, 比如模式生物擬南芥等有專門的數據庫。 在NCBI, Ensembl 和 UCSC中對於同一個物種,編號不統一,在這里整理一下它們之間 ...
HGNC 全稱為HUGO Gene Nomenclature Committee, 叫做 HUGO基因命名委員會,負責對人類基因組上包括蛋白編碼基因, ncRNA基因,甲基因和其他基因在內的所有基因提供一個唯一的,標准的,可以廣泛傳播的symbol; 數據庫的主頁為 http ...
TOP ## 1 簡介 雖然做生長曲線和求代際時間貌似是個很簡單常規的東西,可是到我一直不大確定自己求的對不對... 這次下定決心不再亂做... 不看解釋,跳到[作圖](#tag) ## 2 定義 ### 微生物 * 細菌,真菌 培養和測定 細菌:液體培養,不同的時間測定OD600 ...
細菌-葡萄球菌 葡萄球菌葡萄球菌是一群革蘭氏陽性球菌,因常堆聚成葡萄串狀,故名。多數為非致病菌,少數可導致疾病。葡萄球菌是最常見的化膿性球菌,是醫院交叉感染的重要來源,菌體直徑約0.8μm,小球形, ...