原文:antiSMASH數據庫:微生物次生代謝物合成基因組簇查詢和預測

年 月 日,核酸研究 Nucleic Acids Research 雜志上,在線公布了一個可搜索微生物次生代謝物合成基因組簇的綜合性數據庫antiSMASH數據庫 . 版,前 版年均引用 次,累計引物 可實現基因組與基因組之間的相關天然產物合成基因簇的查詢和預測。 臨床上使用的大部分抗生素和葯物均來自植物或微生物的天然產物。結合基因組挖掘的經典分離與分析法使得能鑒定和描述基於宏基因組的天然產物途 ...

2017-08-01 21:46 0 1296 推薦指數:

查看詳情

微生物代謝關聯分析

://github.com/chentianlu 另外,想要代謝入門的同學可讀讀她寫的代謝數據分析綜述 ...

Sat Dec 12 02:49:00 CST 2020 0 554
基因組數據庫

植物基因組數據庫:1、NCBI中的genome,直接下載NCBI上的基因組文件 ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/ 2、植物基因組數據庫(包含約30個左右的植物,具體查看:) 30個左右植物基因組對應列表 下載 http ...

Sun Jun 07 05:11:00 CST 2020 0 1657
代謝學】2.代謝物鑒定

代謝物的鑒定流程 蛋白基因組和轉錄落后一檔次,代謝學比蛋白又落后一檔次,僅化合的鑒定就讓人頭疼。 流程如下: 化合精確質量數 數據庫檢索 一級鑒定(篩選分子量相同的離子)。解決質量數問題。 一級鑒定(通過同位素分布比對,篩選分子量和元素組成相同的離子)。解決 ...

Mon Dec 30 06:34:00 CST 2019 0 3067
代謝學】2.代謝物鑒定

目錄 代謝物的鑒定流程 從譜圖到峰表 代謝物的鑒定流程 蛋白基因組和轉錄落后一檔次,代謝學比蛋白又落后一檔次,僅化合的鑒定就讓人頭疼。 流程如下: 化合精確質量數 數據庫檢索 一級鑒定(篩選分子量相同的離子 ...

Wed Dec 30 19:48:00 CST 2020 0 625
人類基因組在三大基因數據庫中的不同版本

數據分析中,經常需要下載物種的參考基因組序列,這時有很多數據庫可以選擇,比如NCBI, Ensembl, UCSC這三個通用的數據庫,或者該物種特有的數據庫, 比如模式生物擬南芥等有專門的數據庫。 在NCBI, Ensembl 和 UCSC中對於同一個物種,編號不統一,在這里整理一下它們之間 ...

Mon Feb 15 01:49:00 CST 2016 0 5823
HGNC 數據庫-人類基因組數據庫

HGNC 全稱為HUGO Gene Nomenclature Committee, 叫做 HUGO基因命名委員會,負責對人類基因組上包括蛋白編碼基因, ncRNA基因,甲基因和其他基因在內的所有基因提供一個唯一的,標准的,可以廣泛傳播的symbol; 數據庫的主頁為 http ...

Mon May 15 18:39:00 CST 2017 0 7893
微生物+計算細胞倍增時間

TOP ## 1 簡介 雖然做生長曲線和求代際時間貌似是個很簡單常規的東西,可是到我一直不大確定自己求的對不對... 這次下定決心不再亂做... 不看解釋,跳到[作圖](#tag) ## 2 定義 ### 微生物 * 細菌,真菌 培養和測定 細菌:液體培養,不同的時間測定OD600 ...

Wed Sep 06 22:40:00 CST 2017 0 2280
微生物-細菌-葡萄球菌

細菌-葡萄球菌 葡萄球菌葡萄球菌是一群革蘭氏陽性球菌,因常堆聚成葡萄串狀,故名。多數為非致病菌,少數可導致疾病。葡萄球菌是最常見的化膿性球菌,是醫院交叉感染的重要來源,菌體直徑約0.8μm,小球形, ...

Tue Mar 01 16:59:00 CST 2022 0 658
 
粵ICP備18138465號   © 2018-2025 CODEPRJ.COM