原文:在python中將一個文件的某列替換另一個文件的某列

因為我們測序的時候,引物用的是hg 作為參考序列的,但是就目前來說,hg 注釋信息更為豐富。因此,我們決定將call出來的hg 的snv位點轉化為hg ,進而用annovar進行注釋。 之前有一篇轉載的博文,就如何將不同類型的參考基因組進行轉換。我們用已經轉化好的bed chrom,start,end, 文件去替換用varscan call 出來的位點信息就好。腳本如下, 跑一下,輸出到某個文件就 ...

2017-06-21 16:34 0 1751 推薦指數:

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Python-工具-批量替換EXCLE文件中某的值

由於工作的原因,經常需要查詢統計各地數據,有時結果收集上來后發現需要對其中某些的數據進行轉換,例如將代碼值轉成中文含義。 重新統計需要花費時間和運維精力,所以自己寫了一個簡單的替換腳本。當然,理想狀態還是在查詢統計前就把要求確認。 下面的代碼復制到.py文件中,安裝 ...

Sat Oct 05 17:31:00 CST 2019 0 1597
[python]MergeTxt按合並同一個文件下多個txt文件

開發需求:應項目需要,要將記錄成txt的實驗數據進行按合並(也即為不同文件上下合並),從而進行機器學習訓練. 實驗數據類似如此 模擬驗證數據 運行結果 最終結果 ...

Wed Mar 10 19:02:00 CST 2021 0 257
Python另一個文件導入變量

在寫Python腳本時,我們可能希望從另一個腳本里面導入變量,分享下方法 文件A名為test1.py,變量名為localhost_hostname localhost_hostname = run_cmd("cat /etc/host_name")[1] 文件B名為 ...

Tue Jul 13 18:41:00 CST 2021 0 325
python 拷貝某個文件另一個目錄下

python的shutil包含有很多文件拷貝的函數,各種各樣的,要實現我文章題目的目的,使用shutil.copy函數即可 shutil.copy(文件的路徑,另一個目錄) ...

Mon Dec 17 18:21:00 CST 2018 0 6384
python中執行另一個py文件

使用命令:os.system('python file_name.py') 解釋:os.system是執行當前的系統命令 1、拿windows系統舉例: 2、linux: 例子較多,就不一一舉例了。。。 ...

Wed Apr 29 06:06:00 CST 2020 0 3290
如何調用另一個python文件中的代碼

無論我們選擇用何種語言進行程序設計時,都不可能只有一個文件(除了“hello world”),通常情況下,我們都需要在一個文件中調用另外一個文件的函數呀數據等等,總之要操作其他文件中的代碼,在Java中,只要在同一個文件目錄下,我們就不需要通過import導入,但是在Python中 ...

Mon Jul 10 23:56:00 CST 2017 0 40702
 
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