PacBio下機數據解讀
今天被人問起如何看懂三代的下機數據，雖然解決了別人的問題，但感覺自己還是沒有搞透。 基本的目錄結構： 解壓后的目錄結構： 可以看到數據是以HDF5的格式存儲的，格式介紹：PacBio Sequences的HDF5格式 那么，上面目錄和文件名都有哪些含義呢？仔細 ...
原文：pacbio 原始下機數據h5 文件簡介
pacbio 采用hdf 文件格式保存原始的下機數據，對於RS 測序系統而言，會產生一個 bas.h 的文件 以bas.h 文件為例，看一下有下機數據中保存了那些信息 h dump 工具可以用來查看h 文件的內容： 我從HGAP的wiki 頁面下載了一個測試用的h 文件，文件名為m c s p .bas.h 運行下面命令： 可以看到這個文件中所有的group和dataset, 由於結果太多，只展示 ...
2017-05-26 15:49 0 1392 推薦指數：
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PacBio下機數據如何看？
一開始拿到三代測序的下機數據時，蒙了，readme ？三代測序的下機數據都有哪些，以及他們具體的格式是怎么樣的（以sequel 平台為主）。 測序過程 SMRTbell A adapter通用接頭，兩端的接頭可以一樣也可以不一樣 B barcode(客戶自己設計) I ...
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1.H5的誕生 2.介紹 HTML5 將成為 HTML、XHTML 以及 HTML DOM 的新標准。 HTML5 是 W3C 與 WHATWG 合作的結果。 WHATWG 致力於 web 表單和應用程序，而 W3C 專注於 XHTML 2.0。在 2006 年 ...
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Input <input type="file" /> 標簽 type= "file" 時 定義支持上傳的文件類型：設置 accept accept="image/bmp,image/jpeg,image/jpg,image/png" 支持的類型參考 ...