基因組組裝工具之 SOAPdenovo 使用方法
SOAPdenovo是一個新穎的適用於組裝短reads的方法，能組裝出類似人類基因組大小的de novo草圖。 該軟件特地設計用來組裝Illumina GA short reads，新的版本減少了在圖創建時的內存消耗，解決了contig組裝時的重復區域的問題，增加了scaffold組裝時的覆蓋度 ...
原文：SOAPdenovo組裝軟件使用記錄
背景： 為什么要從頭測序組裝基因組 基因組是不同表型的遺傳基礎 獲得參考基因組是深入研究一個生物體全基因組的第一步也是必須的一步 從頭測序組裝能夠對新的測序物種構建參考基因組 為什么要研究全基因組 確定基因組中缺失了什么 確定難以生化研究的基因和pathways 研究感興趣的pathway通路中的每一個基因 研究基因組的非編碼區域 introns內含子 promoters啟動子 telomeres ...
2017-05-27 13:57 0 5333 推薦指數：
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