CIRI 識別circRNA的原理
CIRI 根據circRNA 連接點處的reads來識別circRNA， 在連接點處的reads 其比對情況非常特殊； CIRI 根據3種模型來識別circRNA， 連接點處的read 叫做junction read A) circRNA 由3個外顯子環化形成， 由於測序讀長 ...
原文：circRNA 序列提取中的難點
在預測circRNA時，都是檢測breakpoint 處的reads 數，最后給出的環狀RNA的ID 都是諸如chr : 這樣的形式，給出了起始和終止位置 對於某一個基因來說，其可能產生的circRNA的類型是多樣的，以下圖為例進行說明 由單個外顯子組成的環狀RNA, 比如 有多個外顯子組成的環狀RNA, 比如 以上的兩種circRNA在序列提取時都非常容易，只需要將circRNA的起始和終止位置 ...
2017-04-19 17:31 0 2528 推薦指數：
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