SAMTOOLS使用 SAM BAM文件處理
【怪毛匠子 整理】 samtools學習及使用范例,以及官方文檔詳解 #第一步：把sam文件轉換成bam文件,我們得到map.bam文件 system"samtools view -bS map.sam > map.bam"; #第二步：sort 一下 BAM ...
原文：SAM/BAM文件處理
當測序得到的fastq文件map到基因組之后，我們通常會得到一個sam或者bam為擴展名的文件。SAM的全稱是sequence alignment map format。而BAM就是SAM的二進制文件 B取自binary 。 那么SAM文件的格式是什么樣子的呢 如果你想真實地了解SAM文件，可以查看它的說明文檔。SAM由頭文件和map結果組成。頭文件由一行行以 起始的注釋構成。而map結果是類似下 ...
2016-12-11 19:46 0 5502 推薦指數：
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