官網 源碼 安裝&使用 BWA http://bio-bwa.sourceforge.net/ ht ...
在生信公司里,有相當一部分人都是負責編寫流程和維護流程。 流程pipeline,就是讓用戶 前端 在填寫配置文件后能夠一鍵運行的腳本,最終自動得出結果,並生成報告,有的公司還會將結果上傳。 自動化pipeline必須具備的功能: 讀取配置文件,生成相應的待執行的腳本 按照先后邏輯關系依次向集群投遞任務 能將大任務分割成小的任務,並行執行,縮短項目周期 必須使用的工具: 一門腳本語言,Shell P ...
2016-11-28 16:03 0 3608 推薦指數:
官網 源碼 安裝&使用 BWA http://bio-bwa.sourceforge.net/ ht ...
1.SOAPDenovo配置文件示例 軟件下載安裝和使用:http://soap.genomics.org.cn/soapdenovo.html asm.cfg 運行腳本: ru ...
,可以快速、批量、靈活的處理數據的提取、統計和整理等耗時耗力的重復性工作。日常生信分析中,多數整理工作 ...
這是一個嘗試性的文章,能不能解決我要解決的問題,並不清楚。 ===本文利用NCBI的blast界面,實現將短序列比對上reference基因組,並實現變異位點可視化。===補言=== 比對常用的是NCBI網站,打開NCBI。(百度 谷歌直接搜索NCBI, 現在中國也在搭建和完善國家生物信息中心 ...
中的定位對基因產物進行了標准化描述,即對基因產物進行簡單注釋,通過GO富集分析可以粗略了解差異基因富集 ...
以一個簡單的項目進行介紹說明: • 最近測試的Tpshop項目是一個B/S架構的Web項目。Tpshop是一個 B2C的電商平台系統,運營模式類似於天貓,京東這些B2C類型網站。 • 項目系統由前台和后台兩部分構成。前台面向購物用戶,包括會員、商品展示、購物車、訂單、支付、用戶 ...
項目原因: 之前參與過一些 工作流 的項目,都是基於 某些 機構現有的 工作流引擎。 項目進行中,最鬧心的 莫過於 業務代碼 和 流程代碼 的 混淆一起。 見過的工作流是怎樣的: >首先一個基於 Silverlight 的 流程UI設計器; 通過設計器 得到一個 流程XML ...
environment 1.網絡平面 management(管理網絡)→軟件安裝,組件通信 provider(提供實例網絡)→:提供者網絡:直接獲取ip地址,實例之間直接互通 ...