基因組組裝算法
目前，構建Graph的主流方法有3種，Overlap-Layout-Consensus（Celera Assembler、PBcR），de Bruijn Graph（SOAPdenovo ） 和 String Graph（Falcon）。 相關文獻 基於De Bruijn圖的宏基因組 ...
原文：基因組組裝工具之 SOAPdenovo 使用方法
SOAPdenovo是一個新穎的適用於組裝短reads的方法，能組裝出類似人類基因組大小的de novo草圖。 該軟件特地設計用來組裝Illumina GA short reads，新的版本減少了在圖創建時的內存消耗，解決了contig組裝時的重復區域的問題，增加了scaffold組裝時的覆蓋度和長度，改進了gap closing，更加適用於大型基因組組裝。 SOAPdenovo是為了組裝大型植物 ...
2016-06-22 11:01 0 10200 推薦指數：
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【轉】單倍型基因組組裝方法
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PacBio長reads的大基因組組裝
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項目數據： kongyu_131_PCRfree_.CCAAT_L006_R1_001.fastq.gz （100X）（19G） kongyu_131_PCRfree_.CCAAT_L006_ ...
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動植物基因組組裝要點小結
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