edgeR的使用
edgeR包是進行RNA-seq數據分析非常常用的一個R包。該包需要輸入每個基因關於每個樣本的reads數的數據，每行對應一個基因，每一列對應一個樣本。 安裝edgeR 先啟動R，然后運行下面代碼：if (!requireNamespace("BiocManager", quietly ...
原文：[轉]edgeR的安裝和后續使用
edgeR的使用 發表於 年 月 日 . edgeR簡介與安裝 edgeR，Empirical analsis of digital gene expression data in R. Differential expression analysis of RNA seq and digital gene expression profiles with biological replicat ...
2015-10-28 22:57 0 1787 推薦指數：
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edgeR包是進行RNA-seq數據分析非常常用的一個R包。該包需要輸入每個基因關於每個樣本的reads數的數據，每行對應一個基因，每一列對應一個樣本。建議使用htseq-count進行統計，輸出文件即可直接使用。如果需要算RPKM，需要自己統計基因長度信息。 第一步：構建 ...
edgeR
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edgeR
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