一、假設檢驗 假設檢驗的基本思路是： 設立零假設（null hypothesis）H0，以及與零假設H0相對應的非零假設（alternative hypothesis）H1，在假設H0成立的前提下 ...

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淺談多重檢驗校正FDR Posted: 四月 12, 2017 Under: Basic By Kai no Comments 例如，在我們對鑒定到的差異蛋白做GO功能注釋后，通常會計算一個p值。當某個蛋白的p值小於0.05（5%）時，我們通常認為這個蛋白在兩個樣本中的表達 ...

matlab自帶函數mafdr，當ttest數較多時，可直接用[FDR, Q]=mafdr(P)；但是Storey procedure在p值少於1000個時會崩潰，此時應改用BH FDR方法：mafdr(P,'BHFDR', true)。該方法對於少量ttest更穩健，但是更保守。 參考 ...

總結起來就三句話： （1）當同一個數據集有n次（n>=2）假設檢驗時，要做多重假設檢驗校正 （2）對於Bonferroni校正，是將p-value的cutoff除以n做校正，這樣差異基因篩選的p-value cutoff就更小了，從而使得結果更加嚴謹 （3）FDR校正是對每個 ...

1.spm初學者教程：http://www.ernohermans.com/wp-content/uploads/2011/11/spm8_startersguide.pdf 2.spm官方mannual：http://www.fil.ion.ucl.ac.uk/ 　　在spm官網上有，spm ...

差異表達分析之FDR 隨着測序成本的不斷降低，轉錄組測序分析已逐漸成為一種很常用的分析手段。但對於轉錄組分析當中的一些概念，很多人還不是很清楚。今天，小編就來談談在轉錄組分析中，經常會遇到的一個概念FDR，那什么是FDR?為什么要用FDR呢?一起來學習吧！ 什么是FDR ...

p值還是 FDR ? 差異分析 如何篩選顯著性差異基因，p value, FDR 如何選 經常有同學詢問如何篩選差異的基因（蛋白）。已經計算了表達量和p value值，差異的基因（蛋白）太多了，如何篩選。其中最為關鍵的是需要對p value進行校正 ...