原文:TopHat2 的安裝

安裝 TopHat 下載最新預編譯版本 解壓 加入 PATH 即可 測試 應該就看到各種信息,包括版本,基本用法等,這樣 tophat 就算安裝完成了。 ...

2015-09-24 10:17 0 2142 推薦指數:

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使用bowtie2 tophat2 及 cufflinks 處理RNA-SEQ數據

未經本人授權禁止轉載。 1 安裝bowtie2 ubuntu上用bin裝ok,suse上編譯裝的,中間包依賴有問題,可用zypper安裝所需包 2 安裝tophat2 ubuntu上用bin裝ok,suse上執行的時候報找不到samtools,但是官網上手冊說tophat2不需要 ...

Tue Jan 19 22:36:00 CST 2016 0 2847
tophat的用法

概述:tophat是以bowtie2為核心的一款比對軟件。 tophat工作分兩步: 1.將reads用bowtie比對到參考基因組上。 2.將unmapped-reads打斷成更小的fragments,比對到參考基因組上,如果比對成功,建立剪切點。 用法:tophat ...

Sun Jul 02 06:31:00 CST 2017 0 2278
tophat輸出結果junction.bed

tophat輸出結果junction.bed BED format BED format provides a flexible way to define the data ...

Thu Oct 03 16:56:00 CST 2013 1 3140
機器學習進階-圖像形態學變化-禮帽與黑帽 1.cv2.TOPHAT(禮帽-原始圖片-開運算后圖片) 2.cv2.BLACKHAT(黑帽 閉運算-原始圖片)

1.op = cv2.TOPHAT 禮帽:原始圖片-開運算后的圖片 2. op=cv2.BLACKHAT 黑帽: 閉運算后的圖片-原始圖片 禮帽:表示的是原始圖像-開運算(先腐蝕再膨脹)以后的圖像 黑帽:表示的是閉運算(先膨脹再腐蝕)后的圖像 - 原始圖像 代碼: 第一步:讀取 ...

Mon Feb 18 21:56:00 CST 2019 0 550
 
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