未經本人授權禁止轉載。 1 安裝bowtie2 ubuntu上用bin裝ok,suse上編譯裝的,中間包依賴有問題,可用zypper安裝所需包 2 安裝tophat2 ubuntu上用bin裝ok,suse上執行的時候報找不到samtools,但是官網上手冊說tophat2不需要 ...
安裝 TopHat 下載最新預編譯版本 解壓 加入 PATH 即可 測試 應該就看到各種信息,包括版本,基本用法等,這樣 tophat 就算安裝完成了。 ...
2015-09-24 10:17 0 2142 推薦指數:
未經本人授權禁止轉載。 1 安裝bowtie2 ubuntu上用bin裝ok,suse上編譯裝的,中間包依賴有問題,可用zypper安裝所需包 2 安裝tophat2 ubuntu上用bin裝ok,suse上執行的時候報找不到samtools,但是官網上手冊說tophat2不需要 ...
概述:tophat是以bowtie2為核心的一款比對軟件。 tophat工作分兩步: 1.將reads用bowtie比對到參考基因組上。 2.將unmapped-reads打斷成更小的fragments,比對到參考基因組上,如果比對成功,建立剪切點。 用法:tophat ...
tophat輸出結果junction.bed BED format BED format provides a flexible way to define the data ...
Cole Trapnell said: there are three strategies:1) merge bams and assemble in a single run of Cuffl ...
使用Tophat+cufflinks分析差異表達 2017-06-15 19:09:43 522 0 0 使用TopHat+Cufflinks的流程圖 ...
1.op = cv2.TOPHAT 禮帽:原始圖片-開運算后的圖片 2. op=cv2.BLACKHAT 黑帽: 閉運算后的圖片-原始圖片 禮帽:表示的是原始圖像-開運算(先腐蝕再膨脹)以后的圖像 黑帽:表示的是閉運算(先膨脹再腐蝕)后的圖像 - 原始圖像 代碼: 第一步:讀取 ...
7. cv2.putText(img, text, loc, text_font, font_scale, color, linestick) # 參數說明:img表示輸入圖片,text表示需要填寫 ...
正常節奏 ...