一:導入R包及需要畫熱圖的數據 library(pheatmap) data<- read.table("F:/R練習/R測試數據/heatmapdata.txt",head = T,row.names=1,sep="\t") 二:畫圖 1)pheatmap(data)#默認參數 ...
快速實現是搜索幫助文檔的首要目的,所以此處涉及實戰的文章一概略去傳統幫助文檔的理論部分,直接上代碼加注釋 本文將介紹R語言下利用ggplot 包制作heatmap的代碼 我是分割線 測試數據: 數據中的空白行 列用以分割heatmap,區別不同的數據處理,如不需要刪除即可。 制作連續型 輸出效果圖: 分級別顯示 輸出效果圖: 我是分割線 轉載請注明出處 ...
2015-07-22 21:13 0 4941 推薦指數:
一:導入R包及需要畫熱圖的數據 library(pheatmap) data<- read.table("F:/R練習/R測試數據/heatmapdata.txt",head = T,row.names=1,sep="\t") 二:畫圖 1)pheatmap(data)#默認參數 ...
生成測試數據 繪圖首先需要數據。通過生成一堆的向量,轉換為矩陣,得到想要的數據。 data <- c(1:6, 6:1, 6:1, 1:6, (6:1)/10, ( ...
聚類分析:對樣品或指標進行分類的一種分析方法,依據樣本和指標已知特性進行分類。本節主要介紹層次聚類分析,一共包括3個部分,每個部分包括一個具體實戰例子。 1、常規聚類過程: 一、首先用dist()函數計算變量間距離dist.r = dist(data, method ...
先來看兩張圖: (1)10年世界杯決賽,冠軍西班牙隊中門將、后衛、中場及前鋒的跑位熱圖 通過熱圖,我們可以很清楚的看出四個球員在比賽中跑動位置的差異。 (2)歷史地震震源位置的熱圖 也可以很清楚的看出,哪個地方是地震的高發地區(頻率最高)。 HeatMap簡介 上面兩張就是熱圖 ...
HeatMap(熱圖)的原理和實現 先來看兩張圖: (1)10年世界杯決賽,冠軍西班牙隊中門將、后衛、中場及前鋒的跑位熱圖 通過熱圖,我們可以很清楚的看出四個球員在比賽中跑動位置的差異。 (2)歷史地震震源位置的熱圖 也可以很清楚的看出,哪個地方是地震的高發地區(頻率最高 ...
這里利用Nathan Yau所著的《鮮活的數據:數據可視化指南》一書中的數據,學習畫圖。 數據地址:http://datasets.flowingdata.com/ppg2008.csv ...
Heatmap熱圖,可以非常直觀的呈現一些原本不易理解或表達的數據,比如密度、頻率、溫度等,改用區域和顏色這種更容易被人理解的方式來呈現。熱圖實際上是三維可視化的俯瞰效果。(顏色代表一個維度)。 我們對熱圖並不陌生,教科書里、天氣預報里的氣溫地圖是最典型的案例。 在用戶體驗制勝的微創新 ...
http://jingyan.baidu.com/article/64d05a0240ec75de55f73bd8.html 利用Excel 2010及以上版本的“條件格式”--“色階”功能可以制作熱圖(heatmap)。可選用Adobe ...