原文:15、R語言聚類樹的繪圖原理

聚類廣泛用於數據分析。去年研究了一下R語言聚類樹的繪圖原理。以芯片分析為例,我們來給一些樣品做聚類分析。聚類的方法有很多種,我們選擇Pearson距離 ward方法。 選擇的樣品有: R語言代碼實現Pearson聚類: R語言作圖結果: 根據這幾行代碼,我們只知道使用cor.dist hclust plot這幾個函數得到的結果,卻看不出這些函數具體做了什么,也不太有人去深究這些問題。 事實上,R ...

2015-05-22 15:26 0 3734 推薦指數:

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R語言-聚類與分類

一.聚類:  一般步驟:   1.選擇合適的變量   2.縮放數據   3.尋找異常點   4.計算距離   5.選擇聚類算法   6.采用一種或多種聚類方法   7.確定類的數目   8.獲得最終聚類的解決方案   9.結果可視化   10.解讀類   11.驗證 ...

Thu Mar 01 07:20:00 CST 2018 0 5996
R語言--聚類

一、定義:將物理或抽象對象的集合分成由類似的對象組成的多個類的過程被稱為聚類 二、距離:歐幾里得度量(euclidean metric)也稱歐氏距離 絕對值距離(manhattan) Lance距離(canberra) 定性變量距離(binary ...

Fri Jul 02 23:31:00 CST 2021 0 326
R語言繪圖——層次聚類圖及樹狀圖添加side bar

聚類分析作圖往往包含熱圖(heatmap)和樹狀圖(dendrogram)。熱圖用來展示每個樣本點數值大小和聚集模式。樹狀圖用來表示樣本之間以及變量之間的距離遠近(或者相似性大小)。R官網目前提供了至少45個可以繪制熱圖的包(packages),其中比較常見的、可以添加行列注釋信息條的聚類作圖包 ...

Mon Apr 20 05:55:00 CST 2020 0 2846
R語言繪圖之plot

Quick-R: Graphs (statmethods.net) Quick-R: Scatterplots (statmethods.net) 數據分析師轉向 R 的主要原因之一是其強大的圖形功能。 在R中,圖形通常是交互式創建的。 head(mtcars) #自帶數據集 ...

Wed Jun 23 22:14:00 CST 2021 0 314
R語言繪圖布局

R語言中,par 函數可以設置圖形邊距,其中oma 參數設置outer margin, mar 參數設置margin, 這些邊距有什么不同呢,通過box函數可以直觀的看到 box 默認在當前圖形繪制邊框,第一個參數which = "plot", 所以在當前圖形上繪制邊框 which 的值 ...

Fri Apr 21 17:58:00 CST 2017 0 10730
R語言——基本繪圖函數

通過一個綜合的例子測試繪圖函數 學習的內容是tigerfish老師的教程。 第一節:基本知識 用seq函數產生100位學生的學號。 用runif函數產生100個隨機數(隨機數是小數),代表課程1的成績,100個數字,最小值50,最大值100 ...

Mon Jun 23 08:35:00 CST 2014 0 8977
R語言繪圖邊框

R語言中, 繪圖邊框一共有3個區域: device region : figure region : plot region : 在描述不同區域大小的時候,有對應的不同參數: din : 返回device region 的寬度和高度, 單位為 inches fin : 返回 ...

Mon May 22 20:19:00 CST 2017 0 1941
 
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