原文:bwa的使用方法

bwa的使用需要兩中輸入文件: Reference genome data fasta格式 .fa, .fasta, .fna Short reads data fastaq格式 .fastaq, .fq step : 建立 Index根據reference genome data e.g. reference.fa 建立 Index File bwa index a bwtsw referenc ...

2015-03-05 19:17 0 23426 推薦指數:

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比對工具之 BWA 使用方法

BWA算法簡介: BWA-bactrack BWA-SW BWA-MEM BWA安裝: BWA使用步驟: 使用BWA構建參考基因組的index數據庫 BWA-MEM比對(BWA-SW 和 BWA-backtrack用的少) 具體命令 ...

Tue Jun 21 02:59:00 CST 2016 0 14164
【轉】GATK使用方法詳解(包含bwa使用

一、使用GATK前須知事項: (1)對GATK的測試主要使用的是人類全基因組和外顯子組的測序數據,而且全部是基於illumina數據格式,目前還沒有提供其他格式文件(如Ion Torrent)或者實驗設計(RNA-Seq)的分析方法。 (2)GATK是一個應用於前沿科學研究的軟件,不斷在更新 ...

Thu Dec 31 00:45:00 CST 2015 0 4801
linux下bwa和samtools的安裝與使用

bwa的安裝流程安裝本軟體總共需要完成以下兩個軟體的安裝工作:1) BWA2) Samtools1.BWA的安裝a.下載BWA (download from BWA Source Forge ) http://bio-bwa.sourceforge.net/bwa.shtmlb.安裝BWA ...

Fri Mar 06 03:06:00 CST 2015 0 12620
RESTful使用方法

操作 並且使用PUT操作和DELETE操作時需在jsp頁面添加隱藏的input標簽,以 ...

Thu Jun 04 06:31:00 CST 2020 0 586
Iperf使用方法

Iperf使用方法 Iperf 是一個網絡性能測試工具。Iperf可以測試TCP和UDP帶寬質量。Iperf可以測量最大TCP帶寬,具有多種參數和UDP特性。Iperf可以報告帶寬,延遲抖動和數據包丟失。 Iperf使用方法與參數說明 參數說明 -s ...

Thu Jul 11 01:22:00 CST 2013 0 8470
ossutil使用方法

wget http://gosspublic.alicdn.com/ossutil/1.6.10/ossutil64官方鏈接https://help.aliyun.com/document_detai ...

Fri Sep 11 18:56:00 CST 2020 0 588
Bitbucket使用方法

,仍然使用Github的 二、創建一個私有項目及上傳: 登錄后鼠標懸停在“Repositories”選擇“ ...

Thu Nov 08 21:58:00 CST 2012 0 31552
idhttpserver的使用方法

idhttpserver的使用方法 1)CommandGet(AContext: TIdContext; ARequestInfo: TIdHTTPRequestInfo; AResponseInfo: TIdHTTPResponseInfo);事件 該事件和IDTCPSERVER ...

Thu Nov 08 23:29:00 CST 2018 0 3319
 
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