原文:得分矩陣PAM與BLOSUM的比較與區別

對於蛋白質序列,計分矩陣主要用於記錄在做序列比對時兩個相對應的殘基的相似度,一旦這個矩陣定義好了以后,比對程式就可以利用這個矩陣,盡量將相似的殘基排在一起,以達到最好的比對。 得分矩陣主要有兩種,第一種就是PAM Point Accepted Multation ,另一種就是BLOSUM。 PAM矩陣 Point Accepted Mutation 基於進化的點突變模型,如果兩種氨基酸替換頻繁,說 ...

2013-12-29 18:44 0 2779 推薦指數:

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比較 "" , '' ,`` 的區別

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Thu Feb 24 22:46:00 CST 2022 0 1392
PAM詳解(二)PAM開發

摘自: http://blog.chinaunix.net/uid-29479952-id-5761564.html 目錄 第二部分 PAM開發... 7 一、Pam應用程序開發... 7 1.1 pam_start() 7 1.2 pam ...

Wed Mar 11 18:10:00 CST 2020 0 1353
PAM詳解(一)PAM介紹

摘自: http://blog.chinaunix.net/uid-29479952-id-5761558.html 目錄 一、Pam概述... 2 二、Pam框架... 2 三、Pam服務模塊... 3 四、Pam庫 ...

Wed Mar 11 18:12:00 CST 2020 0 1517
矩陣和數組的區別

數組中的元素可以是字符等矩陣中的只能是數這是二者最直觀的區別。因為矩陣是一個數學概念(線性代數里的),數組是個計算機上的概念。你見過純粹數學中有數組的概念嗎?沒有。因為計算機上(准確的說是信息科學中)常用到線性代數的知識,就引用了矩陣的概念。 《精通MATLAB6.5版》(張志涌編著 ...

Sun Feb 04 19:21:00 CST 2018 0 11773
矩陣和數組的區別

---恢復內容開始--- 區別: 1.數組中的元素可以是字符或字符串,而矩陣只能是數 2.數學計算的區別矩陣直接用*號相乘,而數組需用.dot() 3.array更靈活,不僅能表示1維、2維,還能表示多維數據,運算速度也更快。 4.矩陣顯示時,元素間無逗號;數組顯示時,元素間用逗號隔開 ...

Wed Nov 07 23:20:00 CST 2018 0 2127
矩陣與張量的區別

關於矩陣和張量的區別有些人可能不太清楚,看了這篇文章相信你會很明白了。矩陣是由括號括起的n×m(例如,3×3)個數字的網格。我們可以加上和減去相同大小的矩陣,只要大小兼容((n×m)×(m×p)= n×p),就將一個矩陣與另一個矩陣相乘,以及可以將整個矩陣乘以常數。向量是一個只有一行或一列的矩陣 ...

Fri May 01 17:27:00 CST 2020 0 639
Eigen ,MKL和 matlab 矩陣乘法速度比較

Eigen 矩陣乘法的速度 < MKL矩陣乘法的速度,MKL矩陣乘法的速度與matlab矩陣乘法的速度相差不大,但matlab GPU版本的矩陣乘法速度是CUP的兩倍,在采用float數據類型時10000*10000的矩陣乘法不到1秒 ...

Sun Jan 06 23:44:00 CST 2019 4 841
 
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