WCS 是倉庫控制系統(Warehouse Control System) 的縮寫。WCS是介於WMS系統和PLC系統之間的一層管理控制系統，，一方面，它與WMS系統進行信息交互，接受WMS系統的指令，並將其發送給PLC系統，從而驅動自動化設備發生動作，另一方面，它將PLC系統的狀態及數據實時反映在界面上，並提供對PLC系統和輸送線的手動調試接口。
WMS是倉庫管理系統(Warehouse Management System) 的縮寫。WMS是整個倉儲物流系統的大腦和中樞，它的主要作用就是思考和運算。
區別：
WCS更多的是與現場的設備和物料發生關系，與業務層面的交集很少。
WMS主要服務於業務管理與報表數據呈現，通過一定的數據算法，將各類數據進行計算，得出各種輸出。
WMS主要負責展示和計算結果，WCS主要負責下發結果上傳數據。
經典的自動化金字塔結構
結構主要包括：
最底層：
現場執行機構，比如電機、氣缸，專機設備（機械手，AGV、機器人等），各類傳感器
中間層：
主要負責收集現場信息並控制現場各類設備或者各類子系統，主要包括WCS（PLC、DCS等）
上 層：
主要負責倉儲物流各環節的業務操作和數據匯總，主要包括WMS
最高層：
主要負責上層與實際生產業務的信息化宏觀管理，比如MES，ERP等等
從金字塔結構中我們可以看到，越位於底層，各個單元越分散，與現場的物理實物越相關，此部分的實時性要求越高。比如眾多的輸送機分散在現場，對於其上要傳輸的物料進行實時的信息采集和相應的動作反應。
同時，越位於高層，該層關注的數據更加偏重業務層面，與現場的物理實物結合約不緊密。同時，高層的數據往往更加偏宏觀、更加是為了付諸於倉儲業務業務辦理和數據統計。
對於智能倉儲物流的數字化信息管理，主要集中在上層WMS和中間控制層。上層WMS相當於人體的大腦中樞神經，中間控制層WCS相當於周圍神經網絡。
事實上，上位WMS在倉儲物流系統中更加偏重於倉儲業務管理，而盡量不去與現場硬件和實物發生直接的鏈接關系，而是經過中間的WCS來進行信息銜接。