shell批量處理vasp任務的小例子

使用vasp計算結構中一系列單個氧缺陷形成能,在此構建氧空位並提交計算任務

首先POSCAR中O的數量減一

#建立氧缺陷

for i in {4,19,40,43};do sed $[i+9]d ori > ${i}.vasp ;done 

#建立目錄下的.vasp列表

mulu=`ls *.vasp`

#建立.vasp對應目錄，將.vasp移入

for i in $mulu;do mkdir ${i}.d;cp $i ${i}.d;done

#建立所有目錄的列表

amulu=`ls -d */`

#提交作業（rtin為筆者自動補齊 POTCAR、INCAR、KPOINTS、vasp.pbs 的腳本）

for i in $amulu;do cd $i;mv * POSCAR;rtin;qsub vasp.pbs;cd ..;done