在上篇 Micro-Manager基本操作指南（上）中我們為大家介紹了如何在Micro-Manager中配置相機，拍圖和修改相機參數。本期我們繼續為大家介紹拍圖時最常用的幾種功能：添加標尺，偽彩和ROI設置。
如何添加標尺？
1. 首先要作物鏡關聯：在進行相機配置時，除了添加 PVCAM 中的 Camera 之外，還要添加物鏡，方法如下：選擇 Demo camera- 雙擊 Dhub，在彈出的窗口中勾選DObjective，點擊OK。
接下來在第5步可以設置您的實驗中常用的物鏡倍率：
然后再保存配置文件就可以啦！
配置好之后，在主界面中用和（上）中添加相機參數同樣的方法將物鏡參數添加到Configuration settings：
2. 進行像素尺寸校准：
選擇 Tools-Pixel size calibration，點擊 new 添加新的像素尺寸校准，在彈出的窗口中選擇相應的物鏡，輸入物鏡倍率和換算后的像素尺寸：
注意：這里的輸入的像素尺寸是實際的相機像素尺寸除以相應的放大倍數得到的結果哦！
校准后，Live窗口左上角顯示的就是實際拍攝的視野尺寸了。
3. 拍照時請在Configuration settings中選擇相應的物鏡。
4. 拍好圖片后， 點擊Image J工具條中的 Analyze-Tools-Scale bar 即可自動添加標尺，還可以設置標尺顯示的長度，字體，位置等。
保存這個配置文件保存標尺設置，下次使用直接打開配置文件即可。
如何給圖像添加偽彩？
Micro-Manager是無法實時添加偽彩的，要將圖片拍好后用 ImageJ 添加哦：
1. 在 Image J工具條中選擇 Image-Color-Merge Channels
2. 在打開的窗口中給圖片分配對應的顏色，就可以添加偽彩：
3. 要對多個通道的熒光圖像進行色彩和成，只需要給不同通道的圖像分配相應的顏色，點擊ok就可以啦！操作完記得保存圖像哦~
如何設置拍照區域（ROI）？
Micro-Manager 中有兩種方法設置感興趣區域（ROI）：
1. 直接使用主界面上的ROI工具，每點擊一次可以在x，y方向上各縮小1/2，要恢復全幅，點擊右邊的按鈕即可。
2. 使用 ImageJ 工具條上的矩形ROI工具手動設置自定義長度的ROI。
打開Image J 工具條中的 Anlayze-Tools-ROI manager，選擇 More-Specify，就可以對ROI的大小和位置進行精確設置。
設置好之后點擊界面上的ROI工具即可僅對ROI區域進行live，同樣，點擊右邊的按鈕恢復全幅。
