對於Linux學習，首先是要去可視化操作，如打開文件，進入目錄，復制，重命名等，這些在Windows系統中，點點鼠標就能解決問題，到了Linux系統中都是需要用命名來操作的。當然，Linux也出了桌面版本的，這些基本操作也能夠通過鼠標完成，但對於做生物信息的數據分析而言，我們使用的Linux服務器，而Linux服務器系統，則是沒有桌面版本的，到頭來還是得學學基礎命令。
有些人，剛開始看到Linux界面和Linux命令時，就會被“嚇唬”住，其實也沒有你想象中的那么難。熟練的生信工作者，也是多操作多練習的，唯手熟爾。
對於shell的命令，基本的有：cd, mkdir, cp, less, more,cat, sort, mv, ls , grep , sed, head , tail, top, htop, pwd, rm, vi, tar, gunzip, tar, wc，uniq; 這些都是在Linux系統上基礎的操作命令，對於以上基礎命令的基本參數和用法，既要非常熟悉，也要非常熟練的在Linux系統上操作的。
但是對於這些命令，其實還有很多非常實用的組合用法，
我將會在自己學習和實踐操作過程中，學習到的一些命令記錄到此，以供自己溫習，以及關注我的人也可以學習相應的一些小技巧，節省搜索總結的時間。
如下：
現有a.txt，b.txt 兩個文件，
查看：可以用cat，more ，less
$more a.txtabcd
$more b.txtab12
現在要分別找出這兩個文件中相同的行和不相同的行：
a中有，b中無的行：
$ cat a.txt b.txt b.txt | sort | uniq -u結果：
cd
a，b中都有的行：
cat a.txt b.txt | sort | uniq -d結果：
ab
對於這個組合命令，很實用於行處理操作，對於生信中的數據，可以首先處理成行，例如對於fasta格式的文件，可以首先先將每一個序列處理成同一行，然后再進行行處理刪除相同或不相同的行即可。
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