問題描述
系統是Win10，嘗試安裝了IDEA的多個版本：2019.3社區版，2020.2社區版，2020.2商業版。
發現都會出現同一個問題：新建的Java或JavaFX項目，編譯報錯
錯誤: 找不到或無法加載主類 com.company.Main
原因: java.lang.ClassNotFoundException: com.company.Main
排查
偶爾會出現項目能編譯運行，對比發現編譯報錯的工程對應編譯參數，少了-classpath xxx這樣的參數（xxx是工程下的編譯輸出子目錄，例如我的是-classpath D:\work\java\tok\out\production\tok）:
"D:\soft\JetBrains\IntelliJ IDEA Community Edition 2019.3.5\jbr\bin\java.exe" "-javaagent:D:\soft\JetBrains\IntelliJ IDEA Community Edition 2019.3.5\lib\idea_rt.jar=64142:D:\soft\JetBrains\IntelliJ IDEA Community Edition 2019.3.5\bin" -Dfile.encoding=UTF-8 -classpath D:\work\java\tok\out\production\tok sample.Main
"D:\soft\JetBrains\IntelliJ IDEA Community Edition 2019.3.5\jbr\bin\java.exe" "-javaagent:D:\soft\JetBrains\IntelliJ IDEA Community Edition 2019.3.5\lib\idea_rt.jar=64158:D:\soft\JetBrains\IntelliJ IDEA Community Edition 2019.3.5\bin" -Dfile.encoding=UTF-8 sample.Main
由於IDEA右下方小窗出現過提示，說Windows Defender可能無法加載config和system文件，於是做過如下嘗試：
- 修改IDEA安裝目錄下
bin/idea.properties中的config和system路徑，從C:/Users/zz/.IdeaC2019.3換成D:/soft/JetBrains/.IdeaC；測試無效 - 關閉Windows Defender，臨時生效，但后續新建工程又出現編譯問題
- 關閉IDEA，刪掉工程的
.idea目錄，重開IDEA，無效 - 關掉當前工程的IDEA窗口，從其他的IDEA窗口，新建工程，並且目錄選擇為剛剛出問題的工程目錄（也即是overwrite），可行
仔細觀察，發現：
- 每個工程根目錄有個同名的
.iml文件 - 每個工程的
.idea/modules.xml文件中，會提到一個.iml文件 - 理論上，兩個地方的
.iml應該一致，而報編譯錯的工程里是不一樣的：- 對於JavaFX工程，是
JavaFxApplication.xml
<module fileurl="file://$PROJECT_DIR$/JavaFxApplication.iml" filepath="$PROJECT_DIR$/JavaFxApplication.iml" />- 對於Java命令行工程，是
untitledxxx.iml
<module fileurl="file://$PROJECT_DIR$/untitled104.iml" filepath="$PROJECT_DIR$/untitled104.iml" /> - 對於JavaFX工程，是
- 而我的工程，並不是叫做
untitled104或JavaFxApplication
嘗試按照Android Studio中的修改gradle插件默認下載地址的方式，也就是改模板的方式，但並沒有在IDEA的目錄下找到相關插件的模板文件，這個方法宣告失敗。給JetBrain Support發了郵件，不知道會不會有回復。
https://stackoverflow.com/questions/44717130/idea-plugin-gradle-wrong-iml-file-used
結論
IDEA 新建工程后，需要手動修改 .idea/modules.xml 中 .iml文件的名字為工程名字，例如:
<module fileurl="file://$PROJECT_DIR$/duoheshui.iml" filepath="$PROJECT_DIR$/duoheshui.iml" />