DGL中文文檔


地址:https://github.com/taishan1994/DGL_Chinese_Manual

 

目錄
begin 安裝 4
使用conda安裝 4
使用pip安裝 4
使用源安裝 4
設置默認的Backend 4

    1. 圖 4
      1.1 關於圖的一些基本定義 4
      1.2 圖、節點和邊 5
      1.3 節點和邊特征 6
      1.4 從外部來源創建圖 7
      ---1.4.1 從外部庫創建 7
      ---1.4.2 從磁盤創建 8
      1.5 異構圖 9
      ---1.5.1 創建一個異構圖 9
      ---1.5.2 處理多種類型 11
      ---1.5.3 從磁盤建立異構圖 12
      ---1.5.4 邊類型子圖 12
      ---1.5.5 將異構圖轉換為同構圖 13
      1.6 在GPU上使用DGLGraph 14
    2. 消息傳遞 15
      2.1 消息傳遞案例 15
      2.2 內置功函數和消息傳遞APIs 15
      2.3 編寫有效的消息傳遞代碼 17
      2.4 在圖的一部分上應用消息傳遞 18
      2.5 在消息傳遞中使用邊權重 18
      2.6 在異構圖中的消息傳遞 18
    3. 建立GNN模塊 19
      3.1 DGL中NN Module的構造函數 19
      3.2 GDL中NN Module前向函數 20
      ---3.2.1 圖檢查和圖類型規范化 21
      ---3.2.2 消息傳遞和歸約 22
      ---3.2.3 歸約得到輸出后更新特征 22
      3.3 異構GraphConv模塊 23
      ---3.3.1 HeteroGraphConv實現邏 23
    4. 圖數據管道 24
      4.1 DGLDataset類 24
      4.2 下載原始數據(可選) 27
      4.3 處理數據 28
      ---4.3.1 處理圖分類數據集 28
      ---4.3.2 處理節點分類數據集 30
      ---4.3.3 處理鏈接預測數據集 31
      4.4 保存和加載數據 33
      4.5 使用ogb包加載OGB數據集 34
    5. 訓練圖神經網絡 35
      總覽 35
      異構圖 35
      5.1 節點分類/回歸 36
      ---5.1.1 總覽 37
      ---5.1.2 編寫神經網絡模型 37
      ---5.1.3 訓練循環 37
      ---5.1.4 異構圖 38
      5.2 邊分類/回歸 40
      ---5.2.1 總覽 40
      ---5.2.2 模型實現和節點分類的區別 40
      ---5.2.3 訓練循環 41
      ---5.2.4 異構圖 42
      ---5.2.5 預測異構圖上現有邊的邊類型 43
      5.3 鏈接預測 45
      ---5.3.1 總覽 45
      ---5.3.2 與邊分類模型實現的區別 45
      ---5.3.3 訓練循環 45
      5.4 圖分類 46
      ---5.4.1 總覽 46
      ---5.4.2 圖批量 47
      ---5.4.3 圖讀出 48
      ---5.4.4 編寫神經網絡模型 48
      ---5.4.5 訓練循環 49
      ---5.4.6 異構圖 50
    6. 大圖的隨機訓練 51
      6.1 通過鄰域采樣訓練GNN以進行節點分類 52
      ---6.1.1 定義鄰域采樣器和數據加載器 52
      ---6.1.2 為minibatch訓練調整你的模型 53
      ---6.1.3 訓練循環 53
      ---6.1.4 對於異構圖 54
      6.2 訓練利用鄰域采樣進行邊分類的GNN 55
      ---6.2.1 定義鄰域采樣器和數據加載器 55
      ---6.2.2 從原始圖中移除minibatch中的邊以進行鄰域采樣 56
      ---6.2.3 調整模型以進行minibatch訓練 56
      ---6.2.4 訓練循環 57
      ---6.2.5 對於異構圖 58
      6.3 通過鄰域采樣訓練GNN進行鏈路預測 60
      ---6.3.1 使用負采樣定義鄰域采樣器和數據加載器 60
      ---6.3.2 調整模型以進行minibatch訓練 61
      ---6.3.3 訓練循環 62
      ---6.3.4 對於異構圖 62
      6.4 自定義領域采樣器 64
      ---6.4.1 用pencil and paper進行鄰域采樣 65
      ---6.4.2 查找消息傳遞依賴項 65
      ---6.4.3 多層minibatch消息傳遞的雙向結構 67
      ---6.4.4 塊在異構圖上工作 68
      ---6.4.5 實現自定義鄰域采樣器 69
      ---6.4.6 為異構圖生成邊界 71
      6.5 實現自定義GNN模塊進行minibatch訓練 71
      ---6.5.1 異構圖 72
      ---6.5.2 編寫可用於同構圖,二部圖和塊的模塊 74
      6.6 對大型圖進行精確離線推斷 74
      ---6.6.1 實現離線推理 75
    7. 分布式訓練 76
      7.1 分布式訓練的預處理 78
      ---7.1.1 負載均衡 79
      7.2 分布式APIs 79
      ---7.2.1 DGL分布式模塊的初始化 79
      ---7.2.2 分布式圖 80
      ---7.2.3 分布式張量 81
      ---7.2.4 分布式嵌入 81
      ---7.2.5 分布式采樣 82
      ---7.2.6 分割工作量 83
      7.3 用於啟動分布式訓練/推理的工具 83


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