多領域綜述 | 框架思維 | 套路思維


BioArt/解螺旋 這一類的公眾號真的非常好,給讀者整理了各種綜述。

個人可以根據自己的需求Rank一下,重點閱讀。

 

框架思維

為了聖杯,持之以恆。

看綜述真滴爽,一直看一直爽。

 

bioart上我感興趣的綜述:

『珍藏版』Nature綜述 | 基因表達調控的新模型

  • Pol I,合成大核糖體RNA(rRNA)的前體
  • Pol II,合成信使RNA(mRNA)和大量非編碼RNA
  • Pol III,合成轉運RNA(tRNA)和小核糖體RNA
  • 絕大多數生物的起始密碼子 (initiation codon)都是AUG,在DNA上則是ATG。

『珍藏版』Cell發布“相分離”研究指南

  • 細胞內的各種組分如何在正確的時間以及空間上聚集以執行其相應的功能
  • 無膜包裹的細胞器是如何形成,以及其物理化學本質

『珍藏版』Nature 綜述 | 細胞命運決定中的轉錄因子與基因組三維構象

  • 以基因轉錄為核心的細胞狀態決定機制應該同時包括轉錄因子、表觀遺傳修飾和基因組三維構象等多層次的調節因素

 

『珍藏版』 Nature綜述 | 表觀遺傳研究將遺傳與環境和疾病相連接

 

『珍藏版』Nat Rev Genetics | 染色質結合RNA助力功能基因組相互作用

  • RNA與染色質的結合機制
  • 鑒定染色體結合RNA的策略
  • 新生RNA的調控功能
  • 重復區域來源的RNA介導基因沉默
  • RNA與核體形成
  • 功能基因組中的RNA

 

致敬大師Donald D. Brown——轉錄調控領域的拓荒者 

  • 病毒入侵機制的研究;氨基酸代謝;第一次揭示了核仁的功能——生產核糖體RNA;該工作把基因通過質粒導入細菌中,開啟了使用DNA重組技術來研究真核基因的時代。
  • 為什么說他是轉錄調控的大師?新時代到來以后,Donald迅速采用重組DNA的方法重新分析了5S rRNA。他在5S rRNA基因的中間位置發現了一個區域,該區域可以控制RNA的生成。第一個被鑒定的真核基因轉錄因子。
  • 激素在青蛙和蟾蜍變態發育過程中的作用
  • 生命科學將在葯物研發過程中扮演着重要的角色
  • Donald對學術界做出的實質性貢獻不僅僅歸功於他做的許多基礎性的研究,還在於他無私地培養了一代如今是學術界中流砥柱的科學家。
  • Two important themes have influenced my 50 years in science. The first is independence. My second theme is the importance of young scientists in research.

致敬Robert Roeder & 紀念真核生物RNA聚合酶發現50周年——轉錄調控研究簡史

  • 初出茅廬發現三種RNA聚合酶
  • 建立體外無細胞轉錄系統
  • 多種轉錄因子的發現
  • 關鍵的轉錄輔因子——中介體復合物(Mediatorcomplex)

『珍藏版』真核轉錄50周年紀念之一:RNA聚合酶II轉錄過程中的DNA模板的轉變過程

『珍藏版』真核轉錄50周年紀念之二:RNA聚合酶Ⅱ延伸因子的發現史

 

『珍藏版』綜述丨伊成器、宋春嘯等全面總結DNA和RNA修飾的檢測方法和研究困境

  • 詳細總結了目前高通量DNA/RNA修飾檢測技術的方法和發現,包括應用三代測序在單鹼基水平鑒定修飾位點,並討論了該領域存在的問題和今后研究的方向。

『珍藏版』NCB綜述 | 染色質復制與細胞的表觀遺傳記憶

 

『珍藏版』環狀RNA的過去,現在與未來

 

Nature | Wnt和TGFβ信號協同調控與個體大小相關的生物行為

  • Wnt和TGFβ信號通路的模式化分布協調了個體大小與機械感受神經元的模式化分布,進而調控分裂起始頻率,最終調節渦蟲的橫裂生殖。

 

『珍藏版』綜述 | 眾人拾柴:NIH表觀遺傳組學藍圖計划的成功 

  • Roadmap
  • 表觀遺傳組學是研究DNA和組蛋白修飾的科學。
  • 聚焦於人類組織和細胞,而不是動物細胞和動物模型
  • 在全基因組水平而不是單個基因位點或者多個基因位點,研究表觀遺傳特點
  • 重點在於發現新的表觀修飾標志物

 

『珍藏版』Science“基因型到表型”特刊之一 | 深度解析人類基因型-表型相關性研究

  • 遺傳分析(genetic analysis)亦稱基因分析,是測定有關某一遺傳性狀的基因數目、基因性質、屬於哪一連鎖群及其在染色體上的座位等的過程。
  • 直接影響和間接影響
  • 混淆影響(Confounding effects)
  • 家族基因型數據的利用
  • 遺傳可能性
  •  連鎖不平衡評分回歸(LDSC)
  • 孟德爾隨機化(MR)
  • 基因-環境(GxE)相互作用

『珍藏版』Science“基因型到表型”特刊之二 | 單細胞基因組學助力人類細胞表型的研究

 

『珍藏版』Mol Cell | 癌症中的單細胞RNA測序:經驗與挑戰

  • 細胞類型、細胞狀態、惡性腫瘤和非惡性腫瘤細胞

 

『珍藏版』Nature 綜述 | 人類疾病遺傳學簡史

  • 系統回顧了人類疾病遺傳學發展的里程碑事件,詳細枚舉了遺傳變異與功能表型關系的全基因組分析方法和未來十年發展的策略和方向,並總結反思人類疾病遺傳學領域研究獲得的經驗教訓。

 

干細胞類器官相關綜述

『珍藏版』Nat Cell Bio綜述 | 干細胞療法研究進展

Science類器官特刊(一)丨類器官新技術——類器官和器官芯片的完美結合

Science類器官特刊(二) | 胚胎干細胞自組裝:哺乳動物的早期胚胎發育

Science類器官特刊(三) | 當類器官技術遇上腫瘤

 

基因編輯相關綜述

特別推薦丨鹼基編輯系統研究進展

『珍藏版』Nature綜述 | 基因編輯技術在臨床應用方面的機遇與挑戰

 

GWAS相關綜述

 

RNA相關綜述

 

其他不太相關的:

『珍藏版』特別推薦丨全景式展現細胞焦亡研究歷程——在細胞死亡的研究中,從來不缺少有趣的故事

『珍藏版』Nature綜述 | 延緩衰老從理論到實踐

『珍藏版』Nature Immunology綜述 | 腫瘤免疫治療抵抗的機制

『珍藏版』Nature綜述 | 利用固有免疫進行免疫治療

 

 

 


 

套路思維

為了恰飯,真的沒辦法。

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Nature子刊告訴你文章頂級套路怎么玩?

 

本實驗室套路在此,熱點的組蛋白修飾基因。

轉錄調控

  • 組蛋白甲基化/組蛋白甲基轉移酶(EZH2)
  • 組蛋白乙酰化與脫乙酰化 組蛋白脫乙酰化酶 HDAC1

 

 

待續~

 


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