VMware 可以在軟件上圖形化窗口直接操作 “壓縮磁盤以回收未使用的空間”（方法：編輯虛擬機設置 -> 選取 “硬盤” -> 點擊右側 “壓縮” 即可）。
VirtualBox 6（目前的最新版本）不支持軟件窗口操作縮小虛擬機磁盤空間或者壓縮虛擬機磁盤空間（不因虛擬機中刪除文件釋放空間），但提供 VBoxManage 命令進行清理。
一、Windows 環境
1、在虛擬機中，從微軟官網下載SDelete （https://technet.microsoft.com/en-us/sysinternals/bb897443），下載完成后解壓，然后 cmd 進入到剛剛存放的目錄下（如 直接放在c盤根目錄下），打開 cmd 執行：
-- 把整個 c 盤下的未使用的磁盤空間標記為 0，執行完后把虛擬機關機
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C:\sdelete -z c:\
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舉例：
2、然后進入宿主機 VBoxManage.exe 目錄（通常為 VirtualBox 安裝目錄），然后執行 BoxManage 命令壓縮 VDI 虛擬機磁盤文件即可。
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D:
cd D:\Program Files\Oracle\VirtualBox
VBoxManage modifyhd F:\VMs\windows_xp_professional_sp3_x86.vdi –compact
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舉例：（我是桌面環境是Ubuntu18.04下安裝的Virtualbox命令執行過程與Windows略有不同“Win7\ ASP\ Config\ -disk001.vdi”是呀回收空間的磁盤）
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pipci@HP:~/vsd/Virtualbox/Win7 ASP work$ vboxmanage modifyhd Win7\ ASP\ Config\ -disk001.vdi -compact
0%...10%...20%...30%...40%...50%...60%...70%...80%...90%...100%
pipci@HP:~/vsd/Virtualbox/Win7 ASP work$
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二、Linux環境
1、在虛擬機中，打開終端執行：
-- 依次執行，執行完后把虛擬機關機
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sudo dd if=/dev/zero of=/empty
sudo rm -f /empty
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2、然后進入宿主機 VBoxManage.exe 目錄（通常為 VirtualBox 安裝目錄），然后執行 BoxManage 命令壓縮 VDI 虛擬機磁盤文件即可。
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VBoxManage.exe modifyhd "E:\VMs\rhel_erver_6.8_x64.vdi" --compact
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參考：https://blog.csdn.net/JohnnySun2015/article/details/105181139