ms中的Amorphous Cell模塊可以用來對建立體系模型。
問題:AC在建模成功后,會發現體系中各個分子的鍵長 鍵角發生變化。
主要原因:AC模塊建模 默認會對分子進行優化,實現能量最小,體系穩定。 故體系每個分子的鍵長 鍵角不同
解決方案:如下圖所示,將options中的optimize cell 勾選框 去掉即可。
額外提下:為了保持建模時,原子的電荷不變,可以energy進行設置。
如圖:在energy中 charges選項 選擇user current 即可保證體系中各個分子的電荷也不發生變化。