1 Header部分
PDF文件的第一行應是由5個字符“%PDF-”后跟“1.N”的版本號組成的標題，其中N是0到7之間的數字。例如下面的：
%PDF–1.0
%PDF–1.1
%PDF–1.2
%PDF–1.3
%PDF–1.4
%PDF–1.5
%PDF–1.6
%PDF–1.7
從PDF 1.4開始，應使用文檔目錄字典中的Version 條目（通過文件Trailer部分的Root條目指定版本），而不是標題中指定的版本。
2 Body部分
PDF文件的正文應由表示文件內容的一系列間接對象組成，例如字體、頁面和采樣圖像。從PDF 1.5開始，Body還可以包含對象流，每個對象流包含一系列間接對象。例如下面這樣：
1 0 obj << /Type /Catalog /Outlines 2 0 R /Pages 3 0 R >> endobj
2 0 obj << /Type Outlines /Count 0 >> endobj
3 0 obj << /Type /Pages /Kids [4 0 R] /Count 1 >> endobj
4 0 obj << /Type /Page /Parent 3 0 R /MediaBox [0 0 612 792] /Contents 5 0 R /Resources << /ProcSet 6 0 R >> >> endobj 5 0 obj
<< /Length 35 >> stream …Page-marking operators… endstream endobj
6 0 obj [/PDF] endobj
3 Cross-Reference Table 交叉引用表部分
交叉引用表包含文件中間接對象的信息，以便允許對這些對象進行隨機訪問，因此無需讀取整個文件即可定位任何特定對象。
交叉引用表以xref開始，緊接着是一個空格隔開的兩個數字，然后每一行就是一個對象信息：
xref 0 7 0000000000 65535 f 0000000009 00000 n 0000000074 00000 n 0000000120 00000 n 0000000179 00000 n 0000000300 00000 n 0000000384 00000 n
上面第二行中的兩個數字“0 7”，0表示下面的對象從0號對象開始，7表示對象的數量，也就是說表示從0到6共7個對象。
每行一個對象信息的格式如下：
nnnnnnnnnn ggggg n eol
- nnnnnnnnnn 長度10個字節，表示對象在文件的偏移地址；
- ggggg 長度5個字節，表示對象的生成號；
- n （in-use）表示對象被引用，如果此值是f （free），表示對象未被引用；
- eol 就是回車換行
交叉引用表中的第一個編號為0的對象始終是f（free）的，並且生成號為65535；除了編號0的對象外，交叉引用表中的所有對象最初的生成號應為0。刪除間接對象時，應將其交叉引用條目標記為“free”，並將其添加到free條目的鏈表中。下次創建具有該對象編號的對象時，條目的生成號應增加1，最大生成號為65535；當交叉引用條目達到此值時，它將永遠不會被重用。
交叉引用表也可以是這樣的：
xref 0 1 0000000000 65535 f 3 1 0000025325 00000 n 23 2 0000025518 00002 n 0000025635 00000 n 30 1 0000025777 00000 n
4 Trailer部分
PDF閱讀器是從PDF的尾部開始解析文件的，通過Trailer部分能夠快速找到交叉引用表和某些特殊對象。如下所示：
trailer << /Size 7 /Root 1 0 R >> startxref 408 %%EOF
文件的最后一行應僅包含文件結束標記%%EOF。關鍵字startxref下面的數字表示最后一個交叉引用表的xref關鍵字開頭的字節偏移量。trailer和startxref之間是尾部字典，由包含在雙尖括號（<<…>>）中的鍵值對組成。