R-rbind.fill|列數不一致的多個數據集“智能”合並，Get！

 

本文首發於"生信補給站"，https://mp.weixin.qq.com/s/aUdleBXDwUUpxGOONllyiA

Q：多個數據集，列數不一致，列名也不一致，如何按行合並，然后保留全部文件的變量並集呢？

A：使用 rbind.fill 函數試試！

 

數據集按列合並時，可以根據merge 或者 dplyr函數包的merge系列函數決定連接方式，達到數據合並的需求。

但是按行合並時常用的rbind，限制條件有點多，發現plyr包的rbind.fill 函數能比較好的解決這個問題。

 

一， 載入數據

#生成隨機數據
data1<- data.frame(x1=runif(5),x2= runif(5),x3= runif(5))
data2<- data.frame(x1=rnorm(5),x4= runif(5))
data3<- data.frame(x3=rnorm(5),x5= rnorm(5))

data1，data2，data3 列數不一致，列名也不一致，如何按行合並，然后保留全部文件的變量並集呢？

可能的問題：

1）rbind： 是根據行進行合並（行疊加）但是要求rbind(a, c)中矩陣a、c的列數必需相等。

2）列數相同的時候，變量名不一致也會合並，導致出錯

 

二 rbind.fill “智能”合並

列數不一致多個數據集，需要按行合並，嘗試使用plyr包rbind.fill函數

library(plyr)
rbind.fill(data1,data2,data3)

吶，就是這樣，rbind.fill函數會自動對應數據列名，不存在的會補充列，缺失時NA填充。

 

精心整理（含圖版）|R語言生信分析，可視化，你要的全拿走，建議收藏！