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腦部地圖集繪制
數據集來源：Harvard-Oxford 腦部地圖集
第一步：下載數據集
數據集文件格式為:
HarvardOxford-cort-maxprob-thr25-2mm.nii.gz
from nilearn import datasets
import warnings
warnings.filterwarnings("ignore")
"""
構建數據集
如果本地有該數據，則直接使用，
否則，從網絡中下載數據
"""
dataset = datasets.fetch_atlas_harvard_oxford('cort-maxprob-thr25-2mm')
atlas_filename = dataset.maps
print('Atlas ROIs are located at: %s' % atlas_filename)
第二步：可視化Harvard-Oxford 腦部地圖集
from nilearn import plotting
plotting.plot_roi(atlas_filename, title="Harvard Oxford atlas")
plotting.show()
玻璃腦圖(Glass brain)繪制
"""
構建數據
如果本地有該數據，則直接使用，
否則，從網絡中下載數據
"""
from nilearn import datasets
import warnings
warnings.filterwarnings("ignore")
motor_images = datasets.fetch_neurovault_motor_task()
stat_img = motor_images.images[0]
玻璃腦圖(Glass brain)繪制:全腦失狀切面
from nilearn import plotting
"""
全腦失狀切面
"""
plotting.plot_glass_brain(stat_img, threshold=3)
玻璃腦圖(Glass brain)繪制:黑色背景
"""
黑色背景設置：black_gb=True
顯示模式：僅顯示x和z視圖 display_mode='xz'
"""
plotting.plot_glass_brain(
stat_img, title='plot_glass_brain',
black_bg=True, display_mode='xz', threshold=3)
玻璃腦圖(Glass brain)繪制:半球矢狀切面
plotting.plot_glass_brain(stat_img,
title='plot_glass_brain with display_mode="lyrz"',
display_mode='lyrz', threshold=3)
plotting.show()
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