背景：
有時候，我們會用IDEA來開發一些小工具，需要打成可運行的JAR包；或者某些項目不是WEB應用，純粹是后台應用，發布時，也需要打成可運行的JAR包。並且，如果依賴第三方jar時，又不希望第三方jar也打入最終的可運行jar包，並且還希望，組織下目錄結構（如把第三方jar文件，放到最終可運行jar包的並行目錄lib下）
開發環境
OS： Windows 8.1
JDK： 1.7.0
開發工具： IntelliJ IDEA 13.1.1
步驟：
1. 選中Java項目工程名稱，在菜單中選擇 F12
2. 在彈出的窗口中左側選中"Artifacts"，點擊"+"選擇jar，然后選擇"from modules with dependencies"。
3. 在配置窗口中配置"Main Class"。
4. 選擇“Main Class”后，選擇“copy to the output and link via manifest”，配置“Directory for META-INF/MAINFEST.MF”，此項配置的缺省值是：D:\workshop\DbUtil\src\main\java，需要改成：D:\workshop\DbUtil\src\main\resources（需要新建文件夾），如果不這樣修改，打成的jar包里沒有包含META-INF/MAINFEST.MF文件，這個應該是個IDEA的BUG（參考：http://stackoverflow.com/questions/15724091/how-to-run-a-jar-file-created-using-intellij-12），配置完成后如下圖所示，點擊OK進入下一步。（如果選擇“extract to the target jar”，即把第三方jar文件，打入最終的可運行jar包時，可以不修改“Directory for META-INF/MAINFEST.MF”的配置，用缺省值即可）
5. 右鍵“<output root>”，選擇“Create Directory”，輸入目錄名：libs
6. 用鼠標按住第三方jar，拖入<output root>下的libs目錄下
7. 用鼠標選中我們將要打出的jar包文件，點擊下方“Class Path:”后面的按鈕，在“Edit Classpath”窗口中，將每個第三方jar文件前加上相對路徑：libs/，形成如：libs/xxx.jar的形式（注意是 / ，而不是 \），這個目錄“libs”，就是前面輸入的那個“libs”,這里如果第三方jar很多的話，可以在“Edit Classpath”窗口中，用鼠標選中所有第三方jar，然后Ctrl+X，把內容cut & copy到UltraEdit里，用列格式一下子全部修改好,再paste到“Edit Classpath”窗口中。完成后如下所示：
8. 完成后，點擊OK，Apply等按鈕，回到IDEA的主菜單，選擇“Build - Build Artifacts”下的“Build”或者“Rebuild”即可生成最終的可運行的jar，並把第三方jar放到和此jar並行的lib目錄下，用winrar打開目標jar，可以看到META-INF/MAINFEST.MF文件被正確包含，內容也正確。
9. 在jar包的輸出目錄下，執行命令：java -jar xxx.jar，即可運行jar文件。