Intel MPI Library學習

參考自https://software.intel.com/zh-cn/get-started-with-mpi-for-linux

Getting Started with Intel® MPI Library for Linux* OS

產品內容

• Runtime Environment (RTO) 運行時環境，包括Hydra流程管理器，支持的實用程序，共享（.so）庫和文檔。

• Software Development Kit (SDK) 軟件開發工具包（SDK）包括所有運行時環境組件以及編譯工具，包括mpiicc之類的編譯器包裝，包括文件和模塊，靜態（.a）庫，調試庫和測試代碼。

先決條件

 在開始使用英特爾®MPI庫之前，請確保完成以下步驟：

1. source mpivars.[c]sh腳本，以為英特爾®MPI庫建立正確的環境設置。它位於<installdir_MPI>/intel64/bin目錄中，其中<installdir_MPI>指向英特爾MPI庫安裝目錄（例如，/opt/intel/compilers_and_libraries_<版本>.<更新>.<程序包號>/linux/MPI）。

2. 創建一個hostfile文本文件，該文件使用每行一個主機名列出群集中的節點。例如：

clusternode1
clusternode2

3. 確保在群集的所有節點之間建立了無密碼的SSH連接。它確保了節點之間MPI進程的正確通信。要建立連接，可以使用位於<installdir>/parallel_studio_xe_<version>.<update>.<package>/bin的sshconnectivity.exp腳本。

完成這些步驟后，您就可以使用英特爾®MPI庫。有關詳細的系統要求，請參閱發行說明中的​​“系統要求”部分。

建立和運行MPI程序

編譯一個MPI程序

如果安裝了SDK組件，則可以使用英特爾®MPI庫構建MPI程序。請執行下列操作：

1. 確保PATH中有一個編譯器。要檢查這一點，請在所需的編譯器上運行which命令。例如：

$ which icc
/opt/intel/compilers_and_libraries_2018.<update>.package#>/linux/bin/intel64/icc

2. 使用適當的編譯器包裝器編譯測試程序。例如，對於C程序：

$ mpiicc -o myprog <installdir>/test/test.c

運行MPI程序

使用mpirun命令運行您的程序。將先前創建的hostfile件與-f選項一起使用，以在指定的節點上啟動程序：

$ mpirun -n <# of processes> -ppn <# of processes per node> -f ./hostfile ./myprog

上面的測試程序以以下格式產生輸出：

Hello world: rank 0 of 2 running on clusternode1
Hello world: rank 1 of 2 running on clusternode2

此輸出表明您已正確配置環境，並且英特爾®MPI庫成功在群集上運行了測試MPI程序。

主要特征

英特爾®MPI庫具有以下主要功能：

• MPI-1，MPI-2.2和MPI-3.1規范符合性
• 支持以下互連結構的任意組合：
  • 共享內存
  • 通過標簽匹配接口（TMI）具有標簽匹配功能的網絡結構，例如英特爾®True Scale Fabric，Infiniband *，Myrinet *和其他互連
  • 通過Open Fabrics Alliance *（OFA *）提供的OFED *動詞實現本機InfiniBand *接口OpenFabrics接口*（OFI *）
  • 通過DAPL *支持RDMA的網絡結構，例如InfiniBand *和Myrinet *
  • 套接字，例如，以太網*，千兆以太網*和其他互連上的TCP / IP
• 支持第二代英特爾®至強融核™處理器。
• （僅SDK）使用以下內容支持英特爾®64架構英特爾®MIC架構集群：
• 英特爾®C ++編譯器15.0及更高版本
• 英特爾®Fortran編譯器15.0及更高版本
• GNU * C，C ++和Fortran 95編譯器
• （僅SDK）C，C ++，Fortran * 77，Fortran 90語言綁定和Fortran 2008綁定
• （僅SDK）動態鏈接

故障排除

如果您在使用英特爾®MPI庫時遇到問題，請執行以下常規過程來解決問題：

• 檢查系統要求和發行說明中的​​已知問題。
• 檢查主機的可訪問性。使用mpirun實用程序在問題主機上運行一個簡單的非MPI應用程序（例如，主機名實用程序）。此檢查可幫助您揭示環境問題（例如，SSH配置不正確）或連接問題（例如，無法訪問的主機）。
• 使用已啟用的調試信息運行MPI應用程序。要啟用調試信息，請設置環境變量I_MPI_DEBUG = 6。您還可以設置其他調試級別以獲取更多詳細信息。此操作可幫助您找出問題所在。

請在《開發人員指南》的“疑難解答”部分中查看更多詳細信息。

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實例測試