PCA
PCA 就是找出數據最主要的方面,用數據里最主要的方面來代替原始數據。
PCA 是最重要的降維方法之一,在數據壓縮、消除冗余和數據噪音消除等領域都有廣泛的應用。
1. PCA最大可分性的思想
最大可分性: 樣本點在超平面上的投影盡可能的分開
2. 基變換(線性變換)
欲獲得原始數據新的表示空間,最簡單方法是對原始數據進行基變換(線性變換)。
3. 方差
如何選擇一個方向或者基才是最優的?基於PCA最大可分思想,我們要找的方向是降維后損失最小,可以理解為投影后的數據盡可能分得開,而分散程度可以用數學上的方差來表示,因為方差越大數據也就越分散。
4. 協方差
在高維變換中,我們希望基變換后選擇的各個方向(或者基)是不相關的,這樣才能表示更多的信息。數學上使用協方差表示相關性:
如果 \(Cov(a,b)=0\) ,則表示兩個字段完全獨立,這也是我們的優化目標。
5. 協方差矩陣
我們想達到的目標(\(Cov(a,b)=0\)) 與 字段內方差 及 字段間協方差 有着密切的關系。假設只有 \(a, b\) 兩個字段,按行組成 \(X\) ,求取協方差矩陣:
可見,協方差矩陣是一個對稱的矩陣,對角線是各個維度的方差(字段內方差),而其它元素是字段間協方差,兩者被統一到了一個矩陣之中。
6. 協方差矩陣對角化
我們的目標是使 \(Cov(a,b)=0\) ,由協方差矩陣可知我們的優化目標 \(C=\frac{1}{m}XX^T\) 等價於協方差矩陣對角化(除對角線以外的其它元素都為0,並且對角線將元素按照大小從上到下排列)。
推導:
7. PCA算法流程
輸入: \(n\) 維樣本集 \(X = (x_1, x_2, ... ,X_m)\),要降維到的維數 \(n^{'}\)
輸出: 降維后的樣本集 \(Y\)
算法:
1)對所有樣本進行中心化 \(x_i = x_i -\frac{1}{m}\sum_{j=1}^mx_j\)
2)計算樣本的協方差矩陣 \(C=\frac{1}{m}XX^T\)
3)求出協方差矩陣的特征值以及對應的特征向量
4)將特征向量按對應特征值大小從上到下排列成矩陣,取前 \(K\) 行組成矩陣 \(P\)
5)\(Y=PX\) 即為原始樣本降維到 \(K\) 維后的數據矩陣
代碼:
"""
這里假設原始數據集為矩陣 dataMat,其中每一行代表一個樣本,每一列代表同一個特征(與上面的介紹稍有不同,上 面是每一列代表一個樣本,每一行代表同一個特征)。
"""
import numpy as np
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# (1)零均值化
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def zeroMean(dataMat):
meanVal=np.mean(dataMat,axis=0) #按列求均值(axis=0),即求各個特征的均值
newData=dataMat-meanVal
return newData,meanVal # newData是零均值化后的數據,meanVal是每個特征的均值
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# (2)求協方差矩陣
# 若rowvar=0,說明傳入的數據一行代表一個樣本;
# 若非0,說明傳入的數據一列代表一個樣本。
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newData,meanVal=zeroMean(dataMat)
covMat=np.cov(newData,rowvar=0)
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# (3)求特征值和特征矩陣
# eigVals存放特征值,行向量
# eigVects存放特征向量,每一列帶別一個特征向量
# 特征值和特征向量是一一對應的
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eigVals,eigVects=np.linalg.eig(np.mat(covMat))
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# (4)保留比較大的前n個特征向量
# 第三步得到了特征值向量eigVals,假設里面有m個特征值,我們可以對其排序,排在前面的n個特征值所對應的特征 # 向量就是我們要保留的,它們組成了新的特征空間的一組基n_eigVect
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eigValIndice=np.argsort(eigVals) #對特征值從小到大排序
n_eigValIndice=eigValIndice[-1:-(n+1):-1] #最大的n個特征值的下標,首先argsort對特征值是從小到大排序的,那么最大的n個特征值就排在后面,所以eigValIndice[-1:-(n+1):-1]就取出這個n個特征值對應的下標(python里面,list[a:b:c]代表從下標a開始到b,步長為c)
n_eigVect=eigVects[:,n_eigValIndice] #最大的n個特征值對應的特征向量
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# (5)獲取降維后的數據
# 將零均值化后的數據乘以n_eigVect就可以得到降維后的數據
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lowDDataMat=newData*n_eigVect #低維特征空間的數據
reconMat=(lowDDataMat*n_eigVect.T)+meanVal #重構數據
8. PCA算法總結
優點:
1) 僅僅依靠方差衡量信息量,不受數據集以外的因素影響
2)各主成分之間相互正交,可消除原始數據成分間的相互影響的因素
3)計算方法簡單,主要運用特征值分解
缺點:
1)主成分各個特征維度的含義具有一定的模糊性,不如原始樣本特征的解釋性強
2)方差小的主成分也有可能含有對樣本差異的重要信息,由於降維丟棄可能會對后續數據處理有影響