Docear使用心得

本文轉載自查看原文 2019-07-02 21:17 2220

超強思維導圖文獻管理軟件Docear使用心得

1.文獻管理與組織

2.思維導圖

3.寫作思路：Docear與pdf閱讀器連用

一、Docear下載與安裝

1.1 系統要求：Windowns(XP,Vista,7,8,or later),Linux,or Mac OS(10.5 or later)

Java 1.5(or later)

1.2 下載鏈接：http://www.docear.org/software/download/

二、Docear 初始化設置

Docear的核心是注釋（使用者自己在pdf中創建的評論、高亮文本與書簽）。Docear最好與其支持的pdf閱讀器聯用，可以讓使用者更好的管理自己閱讀文獻的結果、梳理自己的研究思路以及撰寫論文與報告。

2.1 Docear 注冊

首次啟動Docear時，軟件會詢問你是否注冊、登陸或作為本地用戶使用。注冊登陸后Docear會提供文獻推薦、元數據檢索以及數據備份等功能。激活推薦功能后，Docear會統計分析使用者的思維導圖。若使用者不想使用這些功能，可以不進行注冊與登陸。

若用戶開始設置時未注冊，使用一段時間后，想要注冊，可以鼠標右鍵點擊左側工作區面板的workspace,再出現的文本框中選擇“Register new user”，在跳出的注冊頁面進行注冊。

2.2 Docear 創建項目

2.3 選擇PDF閱讀器

使用者要導入pdf以及pdf中的注釋，就需要選擇能被Docear識別的pdf編輯器。Docear會詢問使用者默認的pdf編輯器，為最大限度發揮Docear的功能建議使用官方推薦的PDF-Xchange Viewer，其支持Docear的所有特性而且是免費的。本人使用的是Acrobat XI Pro同樣可以使用，也有使用者推薦火狐pdf編輯器。下圖是Docear官方提供的pdf編輯器適配詳情。

點擊進入“首選項“可以進行pdf管理。

2.4 Docear 組件介紹

通過隱藏或改變其他組件大小可以擴大思維導圖窗口。雙擊每個組間邊上的小三角可以隱藏組件；按下TAB隱藏所有組件

2.5 創建思維導圖

創建新項目時，文本框左下角有一個選項”include demo files“（默認選中），新手在創建項目時可以不取消此選項，這樣創建的項目中就有示例文件，里面會教使用者怎樣創建和修改思維導圖。

如圖所示，思維導圖是由節點構成的，每個節點都有文字、圖片、公式等內容。圖中”My New Paper“是根節點，之后能添加子節點，子節點之后還能添加子節點。導入Docear的pdfs和注釋也是以節點（pdf和注釋的外鏈接）展示。菜單欄中的”Nodes“選項可以對節點進行各種操作，如，插入節點、編輯節點等。右側文獻面板中的”格式“選項可以更改節點樣式，如節點形狀等。

2.6 使用幫助

點擊菜單欄中的”Help“，里面有能幫助使用者盡快學會使用Docear的幫助文件，如快速入門、Manual...。也可在網絡上搜索Docear使用手冊的中文版本。

三、Docear 組織文獻

3.1 創建類目

Docear在”Literature & Annotations“中組織文獻思維導圖。下圖展示了怎樣編輯現有節點、插入平行節點和下級節點。刪除節點可以選中節點后，按下Delete鍵刪除。

3.2 導入PDFs和注釋，如下圖所示。

3.3 PDFs和注釋歸類

將PDFs和注釋移動到它們應該存在的節點位置。選擇要移動的 PDFs 或注釋，剪切（ CTRL+X）或復制 ( CTR L + C ），選擇其他節點作為子節點粘貼。單擊節點后的小氣泡會展開或折疊該節點。值得注意的是， D oc ea r 不只允許移動PDFs,還可以移動單個注釋到任何位置。

Docear還可以通過菜單和鍵盤快捷鍵移動節點，或直接拖放節點。單擊節點並按住鼠標左鍵不放，移動到其他位置。若在節點上部松開鼠標，則移動節點作為同級節點插入；若在節點右側松開鼠標，則移動節點作為下級節點插入。

當PDFs存在大量信息的時候，可能會創建很多評論或高亮文本，不利於找到指定信息。因此，Docear可以在PDFs文件中創建類目。選中PDFs節點為其創建子節點，然后在子節點中歸類注釋。

3.4 利用PDFs和注釋開展工作

3.4.1 儲存新的PDFs和創建新的注釋

使用者可以在PDF閱讀器中進行注釋與高亮。閱讀結束后可以直接保存在文章所屬項目的Literature repository文件夾下，再更新組織文獻思維導圖，也可以直接導入pdf。

3.4.2 打開PDFs

要再次打開查看pdf文獻時，可以直接單擊PDF或注釋，Docear文件會直接打開PDF文件，還會直接定位到注釋所在頁面。此功能需要與Docear兼容的閱讀器，在該pdf文件已經打開時，再次點擊注釋，可能不會跳轉。

3.4.3 編輯注釋

使用者可以直接打開PDFs修改注釋后再更新思維導圖；也可以直接在Docear中編輯注釋，會自動把改動寫入PDF。

四、參考文獻管理

4.1 自動創建參考文獻

Docear能自動為PDFs提取和檢索題錄數據，當鼠標移到PDF節點時會顯示出來。選擇”Show all attributes“ 時會始終顯示題錄數據。題錄數據不全，可以自己手動添加。

4.2 手動管理文獻

Docear整合了完整的文獻管理軟件JabRef(部分功能未整合)。在參考文獻面板可以創建新文獻，列出所有文獻，編輯條目窗口，在文獻面板對數據的更改，會自動地在思維導圖中更新。如果沒有更新，可以在菜單欄中選擇”Refresh reference“.關閉編輯條目窗口后，會形成格式化參考文獻題錄。

任何節點都可以添加參考文獻信息，添加了參考文獻的節點左上角會出現一個白色小圖標。添加參考文獻到節點中可以直接從文獻面板拖動參考文獻到節點上，也可以選中節點后鼠標右鍵或菜單欄點擊”Add existing reference“添加參考文獻。

將思維導圖中的PDF拖到文獻面板中對應的參考文獻條目上，可以實現PDF與參考文獻的關聯。PDF會添加到對應條目上，文獻信息會自動指定到思維導圖的該PDF中。

可以直接將BibTex格式粘貼到BibTeX source中

4.3 節點與參考文獻的匹配

當文獻列表中的一個條目連接到思維導圖中作為節點的相同文件，題錄數據會添加到該節點。

如果給文獻列表中還沒有PDF連接的條目添加PDF連接，文獻條目中的題錄數據會自動添加到連接該PDF的所有節點。

因為節點和文獻的匹配僅通過文件名實現，而非路徑，所以所有的PDFs不能存在同名文件。否則，Docear會認為文獻列表中有兩個條目連接到相同的PDFs文件。

使用Zotero時尤其要注意，Zotero是每個文件夾里有一個PDF文件，可能會存在同名文件，導入Docear時可能出現問題，請手動檢查

PDF的路徑名選擇英文字符，不要使用雙字節字符如漢字字符，否則不認。

五、草擬論文、作業、書籍、學位論文

5.1 基本流程

首先使用者在開始此步驟之前，應該已經完成了組織文獻,在梳理文章結構時首先，創建文章結構思維導圖。在”My Drafts“文件夾右鍵添加新的思維導圖，選擇適當名字。也可以創建子文件夾組織草稿。

在新建的思維導圖中可以如同組織文獻思維導圖一樣創建節點。還可以隨意創建其他節點，如to-do項目，或准備發表文章的期刊或會議列表等。

需要用到文獻信息時，可以直接從組織文獻思維導圖中復制節點並粘貼到文章結構思維導圖中。如果電腦顯示器夠大的話，推薦打開另外一個Docear實例，這樣組織文獻與文章結構思維導圖能同時存在在顯示器上，可以直接拖動一個實例的節點到另一個實例。

5.2 思維導圖功能

5.2.1 虛擬鏈接

鏈接有四種類型：

本地文件鏈接	如PDFs
虛擬鏈接	按住CTRL鍵不放，在思維導圖中選擇兩個節點，在菜單中選擇”Connect“
超鏈接	如果粘貼一個URL，會創建一個連接到此超鏈接的新節點（紅箭頭）。也可以選中一個節點后，選擇”Add hyperlink“添加超鏈接，或手動編輯超鏈接。
內部鏈接	按住CTRL鍵不放，選擇兩個節點，在菜單中選擇”Link node“.這會創建一個內部鏈接（綠箭頭）。單擊時會自動跳轉到鏈接的節點。

5.2.2 雲框

雲有助於思維導圖中關系緊密項目之間的可視化。選擇一個或多個節點，選擇”Add/remove cloud“。雲的顏色和形狀皆可更改。

5.2.3 格式設定

5.2.4 自動編號

5.2.5 筆記

5.2.6 屬性

屬性用來存儲題錄信息，但可以用它分類文章。例如，可以給文章添加"status"屬性，設定值為”to_read“或”top_read“或”boring“等。也可以給文章指定關鍵詞以備日后搜索。

5.2.7 圖片

在節點中插入圖片的方法有兩種。一種是把圖片作為文件的鏈接插入，這樣圖片將不會在思維導圖中展現，單擊節點，圖片會在外部圖片編輯器中打開。第二種方法是在節點中加入正常的本地文件鏈接或從文件瀏覽器中復制並粘貼圖片。

5.2.8 公式

在思維導圖中可以把LaTeX公式加入到節點，允許插入數學符號和公式。

5.2.9 圖標

圖標有助於高亮某些節點，或者簡化項目管理。插入圖標有兩種方式。一是從菜單插入；二是用圖標工具欄。

5.2.10 概要節點

概要節點有助於概括一些節點的內容。

5.2.11 自由或浮動節點

自由節點好像是在思維導圖中漂浮着的，可以通過拖曳自由放置（把鼠標移到節點的最左側或最右側，點擊再移動）。但是，有時自由節點會給布局帶來一些問題。

六、撰寫論文、作業、書籍、學業論文

6.1 導出思維導圖

6.2 與Microsoft Word 協調工作（建議寫文章時引用文獻還是使用EndNote軟件，選擇文獻與引文格式都比較方面）

在 Docear中，每個文獻以其各自的ID分區，即BiTeX key。要把參考文獻復制到Word，首先在導圖或文獻面板選擇題錄，多選CTRL鍵，然后選擇菜單里的”Copy reference key(s)“,這就把文獻的BiTeX key復制到剪貼板了，多個BibTeX key用逗號分隔。

安裝Docear4Word（需要調用.NET Framework 2.5）后，開始在Word中寫文章，按照草稿，把光標移動到要插入文獻的地方，然后在菜單中選擇”Add Reference“。要插入的文獻清單在新的對話框中打開。如在Docear中復制了BibTeX key(s)，”D→DW“按鈕會被激活。按下它，這些復制的文獻就會被自動選中。也可以一條一條的手工選擇。利用過濾器可以對文獻列表進行篩選。使用者還可以選擇插入文獻的格式。選中菜單中的”Insert Bibliography“按鈕插入文獻。