Java 調用執行其他語言的程序

一般的場景可以通過使用 Runtime.getRuntime().exec() 來完成，該命令返回一個 Process 對象實例。

...
String[] cmdArgs = {"Rscript", medreportPath, "-i", destFilePath1, "-o", webRptPath + "/" + runID};
//        String command = "Rscript " + medreportPath + " -i " + destFilePath1 + " -o " + webRptPath + "/" + runID;
        try {
            Process process = Runtime.getRuntime().exec(cmdArgs);   // 調動外部程序
            BufferedReader br = new BufferedReader(new InputStreamReader(process.getInputStream(), StandardCharsets.UTF_8));  // 獲取標准輸出
            String line;
            while ((line = br.readLine()) != null) {
                System.out.println(line + "\n");
            }
            BufferedReader brError = new BufferedReader(new InputStreamReader(process.getErrorStream(), StandardCharsets.UTF_8));  // 獲取標准錯誤輸出
            String lineError;
            while((lineError = brError.readLine()) != null) {
                System.out.println(lineError + "\n");
            }
            process.waitFor();
        } catch (Exception e) {
            e.printStackTrace();
        }
...

以 Java 調用 Python 為例

1. 使用 Runtime 類

該方式簡單，但是增加了 Java 對python 的依賴，需要事先安裝python，及python程序依賴的第三方庫

Runtime 使用了單例模式，只能使用 Runtime 的 static 方法獲取實例

可以調用 exec() 來執行外部程序，返回 Process 對象實例

public class Runtime extends Object // Runtime 直接繼承 Object
public static Runtime getRunTime()  // 獲取 Runtime 實例的 static 方法
public Process exec(...) throws IOException  // 執行外部程序，exec()有多個重載方法 

例子

Java 程序代碼

package java_python;

import java.io.BufferedReader;
import java.io.InputStream;
import java.io.InputStreamReader;

/*
 *  直接使用 Runtime 調用外部程序
 *  在Java中通過Runtime調用Python程序與直接執行Python程序的效果是一樣的，可以在Python中讀取傳遞的參數，也可以在Java中讀取到Python的執行結果。
 *  需要注意的是，不能在Python中通過return語句返回結果，只能將返回值寫入到標准輸出流中，然后在Java中通過標准輸入流讀取Python的輸出值。
 */
public class RunPythonByRuntime {
    public static void main(String[] args) {
        String exe = "python";  // 使用python3   依賴biopython
        String command = "C:\\Users\\mail.simcere.com\\eclipse-workspace\\python_test\\test\\test01.py";  // python 腳本路徑
        String term = "meningitis";  // 參數
        String[] cmdArr = new String[] {exe, command, term};
        Process process;
        try {
            process = Runtime.getRuntime().exec(cmdArr);  // 執行python程序
            InputStream inputStream = process.getInputStream();  // 獲取python程序的標准輸出
            BufferedReader bufferedReader = new BufferedReader(new InputStreamReader(inputStream));  // 轉換為BufferedReader對象實例
            String line = null;
            while((line = bufferedReader.readLine()) != null) {  // 逐行讀入python程序的輸出結果
                System.out.println(line);
            }
            process.waitFor();
        } catch (Exception e) {
            e.printStackTrace();
        }
    }
}

Python 程序代碼

#coding=utf-8

import sys
from Bio import Entrez
from Bio import Medline

term = sys.argv[1]  # 需要外界傳入 meningitis
retmax = 5  # 控制返回的文獻數目
Entrez.email = "[e-mail]"
handle = Entrez.esearch(db="pubmed", term=term, retmax=retmax)
record = Entrez.read(handle)
handle = Entrez.efetch(db="pubmed", id=record["IdList"], rettype="medline", retmode="text")
records = Medline.parse(handle)
records = list(records)
handle.close()
rst = ""
for record in records:  # record 是一個字典
    rst += ">\nPMID:" + record.get("PMID", "?") \
         + "\nTitle:" + record.get("TI", "?") \
         + "\nAuthors:" + ";".join(record.get("AU", "?")) \
         + "\nAbstract:" + record.get("AB", "?") \
         + "\nKeywords:" + ";".join(record.get("OT", "?")) \
         + "\nMesh Terms:" + ";".join(record.get("MH", "?")) \
         + "\nJournal:" + record.get("TA", "?") \
         + "\nDate of Publication:" + record.get("DP", "?") \
         + "\ndoi:" + record.get("SO", "?") \
         + "\n"
print(rst)

2. 使用 Jython 需要事先安裝 Jython

通過 Jython 可以實現 Java 和 Python 的互相調用，使粒度更加精細，但並沒用解決耦合度的問題。

https://www.cnblogs.com/nuccch/p/8435693.html