MySQL是關系型數據庫。
優勢：
在不同的引擎上有不同 的存儲方式。
查詢語句是使用傳統的sql語句，擁有較為成熟的體系，成熟度很高。
開源數據庫的份額在不斷增加，mysql的份額頁在持續增長。
缺點：
在海量數據處理的時候效率會顯著變慢。
Mongodb是非關系型數據庫(nosql ),屬於文檔型數據庫。文檔是mongoDB中數據的基本單元，類似關系數據庫的行，多個鍵值對有序地放置在一起便是文檔，語法有點類似javascript面向對象的查詢語言，它是一個面向集合的，模式自由的文檔型數據庫。
存儲方式：虛擬內存+持久化。
查詢語句：是獨特的Mongodb的查詢方式。
適合場景：事件的記錄，內容管理或者博客平台等等。
架構特點：可以通過副本集，以及分片來實現高可用。
數據處理：數據是存儲在硬盤上的，只不過需要經常讀取的數據會被加載到內存中，將數據存儲在物理內存中，從而達到高速讀寫。
成熟度與廣泛度：新興數據庫，成熟度較低，Nosql數據庫中最為接近關系型數據庫，比較完善的DB之一，適用人群不斷在增長。
優點：
快速！在適量級的內存的Mongodb的性能是非常迅速的，它將熱數據存儲在物理內存中，使得熱數據的讀寫變得十分快。高擴展性，存儲的數據格式是json格式！
缺點：
不支持事務，而且開發文檔不是很完全，完善。
Mysql和Mongodb主要應用場景
1.如果需要將mongodb作為后端db來代替mysql使用，即這里mysql與mongodb 屬於平行級別，那么，這樣的使用可能有以下幾種情況的考量： (1)mongodb所負責部分以文檔形式存儲，能夠有較好的代碼親和性，json格式的直接寫入方便。(如日志之類) (2)從datamodels設計階段就將原子性考慮於其中，無需事務之類的輔助。開發用如nodejs之類的語言來進行開發，對開發比較方便。 (3)mongodb本身的failover機制，無需使用如MHA之類的方式實現。
2.將mongodb作為類似redis ，memcache來做緩存db，為mysql提供服務，或是后端日志收集分析。 考慮到mongodb屬於nosql型數據庫，sql語句與數據結構不如mysql那么親和 ，也會有很多時候將mongodb做為輔助mysql而使用的類redis memcache 之類的緩存db來使用。 亦或是僅作日志收集分析。