下圖為Eclipse Class Decompiler的首選項頁面，可以選擇缺省的反編譯器工具，並進行反編譯器的基本設置。
缺省的反編譯工具為JD-Core，JD-Core更為先進一些，支持泛型、Enum、注解等JDK1.5以后才有的新語法。
首選項配置選項的含義如下所示：
9-1.重用緩存代碼：只會反編譯一次，以后每次打開該類文件，都顯示的是緩存的反編譯代碼。 9-2.忽略已存在的源代碼：若未選中，則查看Class文件是否已綁定了Java源代碼，如果已綁定，則顯示Java源代碼，如果未綁定，則反編譯Class文件。若選中此項，則忽略已綁定的Java源代碼，顯示反編譯結果。 9-3.顯示反編譯器報告：顯示反編譯器反編譯后生成的數據報告及異常信息。
9-4.使用Eclipse代碼格式化工具：使用Eclipse格式化工具對反編譯結果重新格式化排版，反編譯整個Jar包時，此操作會消耗一些時間。 9-5.使用Eclipse成員排序：使用Eclipse成員排序對反編譯結果重新格式化排版，反編譯整個Jar包時，此操作會消耗大量時間。
9-6.以注釋方式輸出原始行號信息：如果Class文件包含原始行號信息，則會將行號信息以注釋的方式打印到反編譯結果中。 9-7.根據行號對齊源代碼以便於調試：若選中該項，插件會采用AST工具分析反編譯結果，並根據行號信息調整代碼順序，以便於Debug過程中的單步跟蹤調試。
9-8.設置類反編譯查看器作為缺省的類文件編輯器：默認為選中，將忽略Eclipse自帶的Class Viewer，每次Eclipse啟動后，默認使用本插件提供的類查看器打開Class文
