【python】文件處理行與行之間的內容


在處理文本文件時,很多時候需要我們處理跨行的數據,但是用for循環處理不是很方便,想了一個歪招來處理不是很大的數據。

核心思想就是將上一行的東西存在一個列表里,到下一行用完這個數據在循環體里將列表初始化,再將這行數據存到列表里,這樣循環就可以把兩行數據聯系起來。

另外這樣做的還有另外一個好處,就是可以初始化第一行,我們可以通過判斷這個“傳遞列表”空與否來區分標題行的輸入和其他循環體的輸入情況。

from __future__ import division

from sys import argv

from itertools import islice

Mutation = open('DivFile_sort_chr' + argv[1] +'.txt',"r")

REC = open('GeneticMap_Chr' + argv[1],"r")

RECList = open('REC_Chr_' + argv[1], "a")

transList = []

SNPPosList = []

rholist = []

for lines in islice(Mutation, 1, None):
    
    line = lines.strip('\n').split("\t")
    
    POS = line[0]
    
    SNPPosList.append(POS)

print "SNPPos done"

for lines in islice(REC, 1, None):
    
    line = lines.strip('\n').split("\t")
    
    if transList == []:
        
        transList.append((line[0],line[1]))


        
        RECList.write("position\trate\n")
        
        RECList.write('%s\t%s\n' %(line[0],0))

        print "headline"
        
    else:
        
        rho = (float(line[1]) - float(transList[0][1])) / (float(line[0]) - float(transList[0][0]))
        
        for i in SNPPosList:
            
            if int(i) < int(line[0]) and int(i) > int(transList[0][0]):
                
                index = int(SNPPosList.index(i) - 1)
                
                site_rho = (int(i) - int(SNPPosList[index])) * rho
                
                RECList.write('%s\t%s\n' %(i,site_rho))
            
            else:
                
                continue
            
        transList = []
        
        transList.append((line[0],line[1],rho))

        rholist.append(rho)

print rholist
        
for i in SNPPosList:
    
    if i > int(transList[0][0]):
        
        index = int(SNPPosList.index(i) - 1)
        
        site_rho = (int(i) - int(SNPPosList[index])) * rho
        
        RECList.write('%s\t%s\n' %(i,site_rho))
        
    else:
        
        continue
    
Mutation.close()

REC.close()

RECList.close()

 


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