先簡單記錄一下，雖然還有一些疑惑沒有解決。
之前安裝openmpi是用的命令安裝，版本比較低，mfix並行總出現死鎖問題，於是想看看是不是openmpi版本導致，雖然目前還未找到具體原因，但是先記錄下踩到的坑。
下載openmpi最新版本：https://www.open-mpi.org/software/ompi/v3.0/
安裝openmpi具體方法參見：http://www.cnblogs.com/platero/p/4182436.html
安裝主要是這幾個命令：
./configure --prefix="/usr/local/openmpi" make sudo make install
然后~/.bashrc中添加：
export PATH=$PATH:/usr/local/openmpi/bin export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/openmpi/lib/
最后執行命令：
sudo ldconfig
source ~/.bashrc
安裝好以后並行運行mfix：
mpirun -np 8 ./mfixsolver -f clc.mfx
結果報錯：
There are not enough slots available in the system to satisfy the 8 slots
Either request fewer slots for your application, or make more slots available for use.
電腦是6核12線程，之前沒有出現這種問題。如果用低於6線程運行就沒有問題，查了下，發現可以用--oversubscribe參數申請超線程，因此把命令寫成：
mpirun --oversubscribe -np 8 ./mfixsolver -f clc.mfx
就可以了。具體參見：https://stackoverflow.com/questions/35704637/mpirun-not-enough-slots-available
但是問題就來了：
6核12線程對於mpi來說，可用線程到底是6線程還是12線程。低版本openmpi則沒有這個問題。而且開啟--oversubscribe參數后就開始頻繁出現段錯誤，顯然不是很好的選擇。
暫時存疑。
還有就是，在ubuntu16.04上並行出現死鎖問題的case，在ubuntu14.04上卻一切正常，真的是無語~~