Ubuntu-16.04 R 安裝及Jupyter notebook 配置

1. R 安裝

通常在Terminal下直接apt-get 即可，在16.10下可以get到R-3.3.1，目前最新好像是 R-3.4.2，可以去官方網站下載源碼編譯 (https://www.r-project.org)​

sudo apt-get install r-base

 

2. 在jupyter notebook中配置R的kernel

近期在Jupyter下跑python，方便邊調試邊記筆記。因為Jupyter也支持R語言，所以嘗試添加R kernel到Jupyter中。 主要依賴 "IRkernel" 包。(有些包可能需要翻牆才能下載，具體的方法請DIY。) 配置方法如下：

(1) 安裝必要的lib

sudo apt-get install libzmq3-dev libssl-dev libcurl​4-openssl-dev

sudo R # 進入R環境​

> ​ install.packages(c('repr', 'IRdisplay', 'evaluate', 'crayon', 'pbdZMQ', 'devtools', 'uuid', 'digest')) 

注： 會提示選擇mirrors， 建議選擇 0-cloud 

> devtools::install_github('IRkernel/IRkernel')

>​ IRkernel::installspec()

如果顯示​如下結果，說明配置成功。 

[InstallKernelSpec] Installed kernelspec ir in /home/xxx/.local/share/jupyter/kernels/ir​

注意：在jupyter上加載R包時一定要設定鏡像，不然一般會失敗：

# 通過如下命令設定鏡像,比如我選擇鏡像ustc
options(repos = 'http://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN/')
# 檢查鏡像是否更改
getOption('repos')