Rstudio( bioconductor)下載太慢,用國內鏡像


在Rstudio中,下載軟件install.packages()和 bioconductor軟件下載命令

source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("包名")

默認的下載地址都在國外,所以一般來說下載速度十分慢。但其實在國內都有相關的鏡像,可以用來下載相關包

Rstudio直接在Tools-->Global Options-->Packages-->CRAN mirror 選項中選擇一個距離你最近的國內鏡像就行,如China (Shanghai) [https] - Tongji University。這樣以后下載包就都從這個站點下載了

下載 bioconductor中的相關軟件軟件,用下列命令選擇一個國內鏡像

source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
#指定一個離你最近的國內鏡像
options(BioC_mirror="http://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")
biocLite("包名")

如此一下,下載包就會很快,成功率高,也不會出現用國外網址時出現的一些奇怪錯誤

bioconductor一些鏡像的網址:https://www.bioconductor.org/about/mirrors/


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