【DICOM】【轉】dicom文件tag詳解


DICOM tag相關,參考這個文章:http://www.jianshu.com/p/c4e9e18195eb ,或者 http://zhwhong.ml/2017/03/27/LIDC-Dicom-data-and-XML-annotation-parse/

下文摘自:http://blog.csdn.net/wenzhi20102321/article/details/75127101

dicom文件tag詳解

Dicom全稱是醫學數字圖像與通訊,這里講diocm格式文件的tag標記做詳細解讀。 
dicom中文協議文檔:http://download.csdn.net/download/wenzhi20102321/9897014

dicom文件結構:

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dicom文件,整體結構先是128字節所謂的導言部分,跳過就是了,然后是dataElement元素依次排列的方式, 就是一個dataElement接一個dataElement的方式排到文件結尾.我們要讀取dicom里面的各種數據就是在各個數據元素中。通俗的講dataElement就是指tag,就是破Dicom標准里定義的數據字典,每個dataElement中的tag決定自身或整個文件的某些數據類型或自身dataElement內容類別。

標記tag(2字節UInt16分組號和2字節UInt16元素號);

tag是4個字節表示的 前兩字節是組號后兩字節是元素號 比如0008(組號) 0018(元素號)。 
我們獲取dicom里面的數據,就是根據tag,來知道這個dataElement里面是否是我們需要的數據,然后讀取該dataElement里面的數據。

一般我們獲取dataElement中的數據的主要組號

0002組描述設備通訊,0008組描述特征參數,0010組描述患者信息,0028組描述圖像信息參數 
根據這些組號,我們大概就知道這個組的tag里面存放什么數據了吧! 
還是有很多其他組號的,但是里面的數據不常用到,tag總共大約有2000個,但是我們常用的數據就那么幾個!

dicom文件數據中所有dataElement從前到后按tag又可簡單分段:文件元tag,普通tag,像素tag。

1.文件元tag(組號+0000):不受傳輸語法影響,總是以顯示VR方式表示,因為它里面就定義了傳輸語法;文件元tag的dataElement,並沒有多大的意義,它的VF數值是整個組所有dataElement的字節長度,一個dicom中可以只有一個文件元tag,也可以有多個文件元tag。

2.普通tag:除了文件元tag和像素tag,其余的都是普tag數據。包括:圖像寬,高,數據傳輸格式,病人姓名,病人生日,病歷醫院,病歷科室,病情的描述等等數據;

3.像素tag(7fe0,0010):表示dataElement存儲的是病歷的圖像數據。

上面這段話,信息量其實是很多的,比如什么是顯示VR、隱式VR,傳輸語法又是怎么回事?

最關鍵的兩個tag:

1.tag:0002,0010,決定普通tag的讀取方式 little字節序還是big字節序,隱式VR還是顯示VR。由它的值決定

2.tag:7fe0,0010,像素數據開始處

使用工具snate DICOM打開dicom文件,查看數據效果:

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工具下載地址,下載后直接用:http://download.csdn.net/download/wenzhi20102321/9895616 
上面圖片每一行數據就是一個dataElement數據,可以看到tag值,VR值,VL值,VF值。 
但是一般工具也是看不到圖像的tag數據,因為他的VF數據有幾萬個字節,怎么顯示! 
上面可以看到tag的組號和元素號,都是按照順序從小到大的順序排列的,dicom中dataElement也是這樣排列的。 
所以dicom文件都是前面先讀取到很多數據,最后面再讀取圖像的字節數據。

下面是一部分重要的tag展示:

Patient Tag

Group(組號) Element(元素號) Tag Description 中文解釋 VR
0010 0010 Patient’s Name 患者姓名 PN
0010 0020 P1atient ID患者ID LO
0010 0030 Patient’s Birth Date 患者出生日期 DA
0010 0032 Patient’s Birth Time 患者出生時間 TM
0010 0040 Patient’s Sex 患者性別 CS
0010 1030 Patient’s Weight 患者體重 DS
0010 21C0 Pregnancy Status 懷孕狀態 US

Study Tag

Group Elemen Tag Description 中文解釋 VR
0008 0050 Accession Number:A RIS generated number that identifies the order for the Study. 檢查號:RIS的生成序號,用以標識做檢查的次序. SH
0020 0010 Study ID 檢查ID. SH
0020 000D Study Instance UID: Unique identifier for the Study. 檢查實例號:唯一標記不同檢查的號碼. UI
0008 0020 Study Date: Date the Study started. 檢查日期:檢查開始的日期. DA
0008 0030 Study Time:Time the Study started. 檢查時間:檢查開始的時間. TM
0008 0061 Modalities in Study 一個檢查中含有的不同檢查類型. CS
0008 0015 Body Part Examined 檢查的部位. CS
0008 1030 Study Description 檢查的描述. LO
0010 1010 Patient’s Age 做檢查時刻的患者年齡,而不是此刻患者的真實年齡. AS

Series Tag

Group Element Tag Description 中文解釋 VR
0020 0011 Series Number:A number that identifies this Series. 序列號:識別不同檢查的號. IS
0020 000E Series Instance UID:Unique identifier for the Series. 序列實例號:唯一標記不同序列的號碼. UI
0008 0060 Modality 檢查模態(MRI/CT/CR/DR) CS
0008 103E Series Description 檢查描述和說明 LO
0008 0021 Series Date 檢查日期 DA
0008 0031 Series Time 檢查時間 TM
0020 0032 Image Position (Patient):The x, y and z coordinates of the upper left hand corner of the image, in mm. 圖像位置:圖像的左上角在空間坐標系中的x,y,z坐標,單位是毫米.如果在檢查中,則指該序列中第一張影像左上角的坐標. DS
0020 0037 Image Orientation (Patient):The direction cosines of the first row and the first column with respect to the patient. 圖像方位 DS
0018 0050 Slice Thickness:Nominal slice thickness, in mm. 層厚. DS
0018 0088 Spacing Between Slices 層與層之間的間距,單位為mm DS
0020 1041 Slice Location:Relative position of exposure expressed in mm. 實際的相對位置,單位為mm. DS
0018 0023 MR Acquisition 收購者 CS
0018 0015 Body Part Examined 身體部位. CS

Image Tag

Group Element Tag Description 中文解釋 VR
0008 0008 Image Type:Image identification characteristics. CS
0008 0018 SOP Instance UID SOP實例 UID.
0008 0023 Content Date:The date the image pixel data creation started. 影像拍攝的日期. DA
0008 0033 Content Time 影像拍攝的時間. TM
0020 0013 Image/Instance Number:A number that identifies this image. 圖像碼:辨識圖像的號碼. IS
0028 0002 Samples Per Pixel:Number of samples (planes) in this image. 圖像上的采樣率. US
0028 0004 Photometric Interpretation:Specifies the intended interpretation of the pixel data. 光度計的解釋,對於CT圖像,用兩個枚舉值MONOCHROME1,MONOCHROME2.用來判斷圖像是否是彩色的,MONOCHROME1/2是灰度圖, RGB則是真彩色圖,還有其他. CS
0028 0010 Rows: Number of rows in the image. 圖像的總行數,行分辨率. US
0028 0011 Columns: Number of columns in the image. 圖像的總列數,列分辨率. US
0028 0030 Pixel Spacing:Physical distance in the patient between the center of each pixel. 像素間距.像素中心之間的物理間距. DS
0028 0100 Bits Allocated:Number of bits allocated for each pixel sample. Each sample shall have the same number of bits allocated. 分配的位數:存儲每一個像素值時分配的位數,每一個樣本應該擁有相同的這個值. US
0028 0101 Bits Stored:Number of bits stored for each pixel sample. Each sample shall have the same number of bits stored 存儲的位數:有12到16列舉值.存儲每一個像素用的位數.每一個樣本應該有相同值. US
0028 0102 High Bit:Most significant bit for pixel sample data. Each sample shall have the same high bit. 高位. US
0028 0103 Pixel Representation:Data representation of the pixel samples. Each sample shall have the same pixel representation.Enum: 0000H=unsigned integer,0001H=2’s omplement. 像素數據的表現類型:這是一個枚舉值,分別為十六進制數0000和0001.0000H = 無符號整數,0001H = 2的補碼. US
0028 1050 Window Center 窗位. DS
0028 1051 Window Width 窗寬. DS
0028 1052 Rescale Intercept:The value b in relationship between stored values (SV) and the output units.Output units = m*SV + b.Required if Modality LUT Sequence (0028, 0030) is not present. 截距:如果表明不同模態的LUT顏色對應表不存在時,則使用方程Units = m*SV + b,計算真實的像素值到呈現像素值。其中這個值為表達式中的b。 DS
0028 1053 Rescale Slope:m in the equation specified by Rescale Intercept (0028,1052).Required if Rescale Intercept is present. 斜率.這個值為表達式中的m。 DS
0028 1054 Rescale Type:Specifies the output units of Rescale Slope (0028,1053) and Rescale Intercept (0028,1052).Enum: US=Unspecified Requried if Photometric Interpretation is MONOCHROME2, and Bits Stored is greater than 1.This specifies an identity Modality LUT transformation. 輸出值的單位.這是一個枚舉值, LO

所有dicom的tag列表(英文版):http://www.sno.phy.queensu.ca/~phil/exiftool/TagNames/DICOM.html 
看了這些tag,應該對dicom文件有了更多了了解吧。 
關於VR的詳細知識,可以看我詳細介紹VR的博客頁面。 
其實這些數據用得並不多,一般就用到病人的姓名,病人ID,醫院,科室,還有設置圖像要用到圖形的窗位和窗寬。

dicom傳輸的相關知識也只能介紹到這里,很多知識還沒有理解透徹,只是把這些知識羅列出來,給大家參考一下!

dicom文件解析知識的其他地址:

1.dicom文件詳解

http://blog.csdn.net/wenzhi20102321/article/details/75127362

2.dicom文件的值類型VR詳解

http://blog.csdn.net/wenzhi20102321/article/details/75127140

3.dicom文件tag詳解

http://blog.csdn.net/wenzhi20102321/article/details/75127101

4.android 解析並顯示dicom文件的數據和圖像

http://blog.csdn.net/wenzhi20102321/article/details/75040225

5.java代碼使用ImageJ解析dicom文件成圖片

http://blog.csdn.net/wenzhi20102321/article/details/74995084

前面5個是我自己寫的,后面是一些我自己看過的相關資料:

6.Dicom文件解析

http://blog.csdn.net/leaf6094189/article/details/8510325

7.使用dcm4che3獲取Dicom的bmp格式縮略圖

http://blog.csdn.net/Kerrigeng/article/details/60866656

8.使用dcm4che3解析DICOM中,中文亂碼問題

http://blog.csdn.net/Kerrigeng/article/details/53942846

9.使用dcm4che3對jpeg壓縮的dcm文件進行解壓

http://blog.csdn.net/Kerrigeng/article/details/62215647

10.DICOM的常用Tag分類和說明

http://www.cnblogs.com/stephen2014/p/4579443.html

11.dicom的大牛zssure的博客,幾十篇文章

http://blog.csdn.net/zssureqh/article/category/1389985

12.dicom協議中文文檔下載

http://download.csdn.net/detail/wenzhi20102321/9897014

13.Sante DICOM Editor 4,查看dicom文件的工具,直接打開用

http://download.csdn.net/detail/wenzhi20102321/9895616


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