問題：獲得目錄中的 .fna 后綴的文件路徑
- 通過 makeblastdb 能獲得用於 BLAST 的數據庫文件，這些文件包括原始數據
.fna，和幾個在原名基礎上增加后綴為名字的文件，例如.fna.nsq。 - Blast 的時候需要指定的是
.fna文件，而不是其他的那些。因此需要自動讀取數據庫文件夾中的不帶后綴的文件。 - 如果做的是蛋白質的數據庫，需要的是
.faa的文件。
解決
- 直接用
in不能篩選出.fna結尾的名字。需要使用正則表達式。
import os
import re
mask = re.compile('.+fna$') # $說明從后開始匹配
# 最好先看一下當前路徑是什么
os. getcwd()
# 獲得文件夾里面所以文件名
file_names= os.listdir()
# 或者隨便用個例子
file_names = ['1.fna', '1.fna.nsq', '1.fna.nsi',]
# 方法1 for循環，遍歷每個文件名，返回fna結尾的文件（事先知道只有一個）
for db in file_names:
if mask.match(db):
path = db
path
# 方法2 方法1用條件表達式寫出來
path = [db for db in file_names if mask.match(db)] # 注意[ ]不能少
path
# 方法3 filter 函數
path = list(filter(mask.match, file_names))[0]
path
# 以上三個path都會是1.fna
# 把這個和當前的目錄組合起來就是數據庫所在的路徑
print(os.path.join(os.getcwd(),path))
說明
搜問題的時候看到了第二種寫法，覺得挺有趣的，就稍微看了下。
如何理解conditional expression
a, b, c = 1, 2, 3
# 1.常規
if a>b:
c = a
else:
c = b
# 2.表達式
c = a if a>b else b # 先執行中間的if，如果返回True，就是左邊，False是右邊。
# 3.二維列表
c = [b,a][a>b] #實際是[b,a][False]，因為False被轉換為0，所以是[1,2][0]，也就是[1]
# False返回第一個，True 返回第一個。
# 4
c = (a>b and [a] or [b])[0]
# 這個比較好玩，False and [1] or [2]，因為and的優先級高於or，先算and
# False和[1] and之后還是False，和[2]or之后卻成了[2]
# True 和[1] and之后是[1]，[1]和[2]or結果是[1]
# 也就是False和True在和別人做boolean運算的時候，根據and還是or，F和T在前在后有不一樣的數據轉換規則。
參考
Python關於條件表達式的說明 PEP308